subprocess.call（）的权限被拒绝错误

Question

我正在尝试将一些 nrrd 文件转换为 Dicom 文件，并且我有此代码 sn-p

NRRD_TO_DICOM = '/mnt/sdc1/user/6363/'
def NRRDToDICOM(filename, output_folder_name):
    subprocess.call([NRRD_TO_DICOM, filename, output_folder_name])

NRRDToDICOM('ARTERIAL.nrrd', '/mnt/sdc1/user/6363/ARTERIAL/')

我尝试从我的 jupyter notebook 运行它，但它给了我

 PermissionError                           

Traceback (most recent call last)
<ipython-input-6-5ee279d7c7db> in <module>()
      3     subprocess.call([NRRD_TO_DICOM, filename, output_folder_name])
      4 
----> 5 NRRDToDICOM('ARTERIAL.nrrd', '/mnt/sdc1/Ryan/6363/ARTERIAL/')

<ipython-input-6-5ee279d7c7db> in NRRDToDICOM(filename, output_folder_name)
      1 NRRD_TO_DICOM = '/mnt/sdc1/Ryan/6363/'
      2 def NRRDToDICOM(filename, output_folder_name):
----> 3     subprocess.call([NRRD_TO_DICOM, filename, output_folder_name])
      4 
      5 NRRDToDICOM('ARTERIAL.nrrd', '/mnt/sdc1/Ryan/6363/ARTERIAL/')

PermissionError: [Errno 13] Permission denied

之后我将保存的文件保存为py 文件并在完成后从终端运行它

chmod +x /mnt/sdc1/user/6363/ARTERIAL/

chmod +x /mnt/sdc1/user/6363/

但同样的错误仍然存​​在， 任何有关我如何解决此问题的建议都会非常有帮助，在此先感谢。

Answer 1

您正试图将/mnt/sdc1/user/6363/ 作为命令的名称运行，但显然它不是一个。

目前尚不清楚您要实际运行什么，但这根本不是正确的方法。

您作为第一个参数传递给subprocess.Popen() 的列表中的第一项及其各种便利包装器需要是可执行文件，就像您需要键入命令而不是目录一样名称，在 shell 提示符下。

我猜你的代码应该是这样的

def NRRDToDICOM(filename, output_folder_name):
    subprocess.call(['/usr/bin/nrrdtodicom', filename, output_folder_name])

如果可执行文件的路径已经在您的PATH 上，则可能不需要它（因为它可能应该是——我主要放在/usr/bin/ 中以明确表明我们正在谈论这种类型的事情），如果你绝对坚持，你当然可以将它保存在一个变量中，但这似乎是一件奇怪的事情（尽管如果可以以许多不同的名称安装具有所需 API 的命令，那么也许它使其可配置或至少易于更改是有意义的）。

Answer 2

使用-R 递归每一级目录：

chmod +x -R /mnt/sdc1/user/6363/ARTERIAL/