unix：我可以删除目录中不包含文本的文件吗？答案

【问题标题】：unix: Can I delete files in a directory that do not contain text?unix：我可以删除目录中不包含文本的文件吗？
【发布时间】：2016-02-22 17:04:19
【问题描述】：

我可以删除目录中不包含任何文本的文件吗？这些是扩展名为“.fasta”的文本文件。最初我正在运行这个脚本：

for g in `cat genenames.txt` ; do cat *${g}_*.fa > $g.fasta ; done

在如下文件列表中：

id_genename_othername.fa

但在某些目录中，并非列表 (genenames.txt) 中的所有基因名称都有名称匹配的文件。所以有时我会收到这样的信息：

cat: *genename_*.fa: No such file or directory

上面的代码仍然用不存在的基因名创建了一个“.fasta”文件，我想删除它。谢谢。

【问题讨论】：

当您说“无文本”时，文件为空，即。文件大小为 0 字节？
是的，文件是0字节。

标签： unix

【解决方案1】：

假设你的脚本使用#!/bin/bash，我会这样做

shopt -s nullglob
while IFS= read -r pattern; do
    files=( *"$pattern"*.fa )
    if [[ "${#files[@]}" -eq 0 ]]; then
        echo "no files match pattern *$pattern*.fa"
    else
        cat "${files[@]}" > $pattern.fasta
    fi
done < genenames.txt

【讨论】：

这非常接近，但并不总是有效，具体取决于文件夹中的内容。例如，我的genenames.txt 文件列出了两个基因：gene1 和gene2。这些在每个基因后带有换行符的文本文件中。如果文件夹包含 id_gene1_othername.fa 的文件，那么我会得到正确的输出：一个名为 gene1.fasta 的文件，其中的数据来自原始文件。但是在一个有文件id_gene2_othername.fa，但没有文件名有gene1的文件夹中，输出的是gene1.fasta和gene2.fasta两个文件，都是gene2的拼接数据。
在那种情况下，文件名中是否有both“gene1”和“gene2”的文件？也许我们只需要带有 2 个下划线的 files=(*_"$pattern"_*.fa)
所有文件都是gene1或gene2。到目前为止，我正在工作的文件夹中的文件要么全是基因 1，要么全是基因 2，但我会遇到文件夹中同时包含两个基因的文件夹。但是为了确保我清楚，即使两个基因都存在于文件夹中，每个文件也只是一个或另一个。
是的！ files=(*_"$pattern"_*.fa) 已修复。谢谢。

【解决方案2】：

您是否尝试过以下方法？

for g in `cat genenames.txt` ; do cat *${g}_*.fa 2>/dev/null > $g.fasta ; done

这应该可以防止未找到的错误生成文件

【讨论】：

这消除了错误，但仍然制作了空文件。