【问题标题】:Scikit-learn(Python) Different metric results(f1 score) for StratifiedKFoldScikit-learn(Python)StratifiedKFold的不同指标结果(f1分数)
【发布时间】:2017-03-09 14:11:14
【问题描述】:

我想为我的 StratifiedKFold 找到最佳拆分,并在最佳拆分上构建我的模型。代码如下:

def best_classifier(clf,k,x,y):

    skf = StratifiedKFold(n_splits=k,shuffle=True)

    bestclf = None
    bestf1 = 0
    bestsplit = []
    cnt = 1
    totalf1 = 0

    for train_index,test_index in skf.split(x,y):
        x_train,x_test = x[train_index],x[test_index]
        y_train,y_test = y[train_index],y[test_index]
        clf.fit(x_train,y_train)
        predicted_y = clf.predict(x_test)
        f1 = f1_score(y_test,predicted_y)
        totalf1 = totalf1+f1
        print(y_test.shape)

        print(cnt," iteration f1 score",f1)
        if cnt==10:
            avg = totalf1/10
             print(avg)
        if f1>bestf1:
            bestf1 = f1
            bestclf = clf
            bestsplit = [train_index,test_index]

        cnt = cnt+1   
    return [bestclf,bestf1,bestsplit]

此函数返回我的分类器数组(适合最佳拆分)、最佳 f1score 和最佳拆分的索引

我这样称呼它:

best_of_best = best_classifier(sgd,10,x_selected,y)

现在,由于我捕获了最佳拆分和我的分类器,我再次对其进行相同拆分测试,以检查我得到的结果是否与我在函数中得到的结果相同。但显然事实并非如此。 代码:

bestclf=  best_of_best[0]
test_index = best_of_best[2][1]
x_cv = x_selected[test_index]
y_cv = y[test_index]
pred_cv = bestclf.predict(x_cv)
f1_score(y_cv,pred_cv)

方法为 best_classifier 时的结果:

(679,)
1  iteration f1 score 0.643298969072
(679,)
2  iteration f1 score 0.761750405186
(678,)
3  iteration f1 score 0.732773109244
(678,)
4  iteration f1 score 0.632911392405
(678,)
5  iteration f1 score 0.74179743224
(678,)
6  iteration f1 score 0.749140893471
(677,)
7  iteration f1 score 0.750830564784
(677,)
8  iteration f1 score 0.756756756757
(677,)
9  iteration f1 score 0.682170542636
(677,)
10  iteration f1 score 0.63813229572
0.708956236151

当我预测在 statifiedkfold 的最佳分割之外时的结果

0.86181818181818182

我们可以看到这个f1分数在10折中没有观察到。为什么会这样?我做错了什么吗?我的方法逻辑错了吗?

【问题讨论】:

  • 在不太了解 sklearn StratifiedKFold 的情况下,我认为 shuffle=True 会在每个 skf.split 之前对数据进行洗牌。如果将其设置为 False,它看起来如何?您还可以保留shuffle=True 并设置random_state = 1 以在每次迭代中实现相同的随机播放。
  • 没有试过但没用。即使我设置了 shuffle=True,我也会为每个 shuffle 捕获我的拆分索引。

标签: python machine-learning scikit-learn artificial-intelligence


【解决方案1】:

解决了。问题是因为我没有将我的 clf 对象深度复制到 bestclf。每次用于运行我的 bestclf 引用的第 K 次折叠更改为当前 clf 时,因为我没有进行深度复制。

bestclf = copy.deepcopy(clf)

【讨论】:

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