用二维坐标之间的距离填充一个numpy零数组[重复]

Question

我认为以前有人问过这个问题，但我正在尝试实现以下内容：我有一个元组列表，其中包含我拥有的 N 个粒子的 2D 坐标。我已经定义了一个 numpy.zeros((N,N)) 数组来存储它们之间的距离。我怎样才能最快地做到这一点？

提前感谢您的帮助！ :)

编辑添加：我已经编写了一个函数来测量两个元组之间的距离，并且想知道如何迭代它！

我的测距功能：

def calc_distance(p1, p2):
    distance = numpy.linalg.norm(p1 - p2)
    return distance

Answer 1

距离矩阵就是你要找的：

coords = [(0,0), (1,1), (3,2)]

from scipy.spatial import distance_matrix

distance_matrix(coords, coords)

输出：

array([[0.        , 1.41421356, 3.60555128],
       [1.41421356, 0.        , 2.23606798],
       [3.60555128, 2.23606798, 0.        ]])