knitr 可以获取从另一个文件夹获取脚本的脚本吗？答案

【问题标题】：Can knitr source a script which sources a script from another folder?knitr 可以获取从另一个文件夹获取脚本的脚本吗？
【发布时间】：2017-03-20 21:57:09
【问题描述】：

我有一个项目，我将 .rmd 文件放在名为 docs 的单独文件夹中。我的 R Markdown 文档如下所示：

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title: "test"
output: pdf_document
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## R Markdown
```{r summary}
knitr::opts_knit$set(root.dir = normalizePath("../"))
source('../test.R')
```

我的 test.R 脚本位于根文件夹中，如下所示：

source('helloWorld.R')
print("Hello World")

helloWorld.R 脚本如下所示：

print("Hello World from separate script")

我的两个问题是：

【问题讨论】：

源总是相对于当前工作目录，而不是文件本身。如果你想从同一个文件中获取，也许可以试试这个答案的解决方案：stackoverflow.com/questions/42815889/…
@MrFlick 我很欣赏这个解决方法：如果我不知道如何在我的 R Markdown 脚本中设置工作目录，我可能会使用它。
setwd 将在 rmarkdown 中工作，尽管 knitr 可能会警告您使用它并会在块的末尾更改回来。在回答您的第一个问题时，knitr 的 root_dir 是一个特定于 knitr 的选项 - 它可能不会直接更改工作目录。
@dash2 你是对的！谢谢你。如果我将 .rmd 文件中的两行 R 代码替换为 setwd('..') 和 source('test.R')，我的脚本实际上可以正常工作。
@dash2 您能否将您的评论放入答案中，以便我将其投票为正确答案？

标签： r knitr

【解决方案1】：

setwd 将在 rmarkdown 中工作，尽管 knitr 可能会警告您使用它并会在块的末尾更改回来。在回答您的第一个问题时，knitr 的 root_dir 是特定于 knitr 的选项 - 它可能不会直接更改工作目录。

【讨论】：