Python子进程未正确执行程序答案

【问题标题】：Python subprocess not executing program correctlyPython子进程未正确执行程序
【发布时间】：2013-03-28 20:43:25
【问题描述】：

我正在尝试在 Python 的 shell 中执行 Fortran 程序。我使用subprocess 调用Fortran 程序并传递参数（需要两个输入文件）。我就是这样做的：

COMMAND = '/path/to/FORTRAN/program << !\n' + INPUT_FILE1 + '\n' + INPUT_FILE2 +'\n!'
return = subprocess.call(COMMAND, shell=True)

不幸的是，Fortran 程序退出：

? FORTRAN Runtime Error:
? Attempt to read past end of file
? READ(UNIT=22,...

这不是输入文件或 Fortran 程序的问题。当我在我的 shell 中执行此操作时：

$>/path/to/FORTRAN/program << !
>INPUT_FILE1
>INPUT_FILE2
>!

一切都按预期工作（没有Attempt to read past end of file）。

我无权访问 Fortran 源代码，因此无法检查其中发生了什么。我认为这与我通过 subprocess 调用程序的方式有关 - 我只是不知道是什么。

我使用的是 Python 2.6.6。

快速解释：Fortran 程序将提示输入两个输入文件，但它不会将它们识别为命令行选项（它们不能随程序调用一起提供）。如果你想运行它——比如说一个 shell 脚本（批处理模式）——你需要捕获返回命令来执行命令，还要提供这两个文件。 << ! 打开一个“列表”，因为没有更好的术语。以下命令被传递给程序，该程序等待执行，直到输入!。

我已经多次成功地使用了这种方法（不同的 Fortran 代码），并且在这个方法中，使用了 C shell 脚本（不是 Python）。

【问题讨论】：

我对从终端运行 FORTRAN 知之甚少 - << 的意义是什么？那是来自stdin 还是其他地方？也许问题在于您将输入文件作为参数提交，但它期望它会解析一个缓冲区。如果没有有关该程序的更多信息，很难说。
我试图通过调用一个转储其标准输入的小程序来重现，并且在这种情况下命令行和subprocess 都可以工作。

标签： python subprocess

【解决方案1】：

你可以试试"\r\n"（tty 换行）：

from subprocess import Popen, PIPE

p = Popen(["/path/to/FORTRAN/program"], stdin=PIPE,
          bufsize=1, close_fds=True)
p.communicate("INPUT_FILE1\r\nINPUT_FILE2")
rc = p.returncode

最后有/没有"\r\n"。

【讨论】：

这行得通，稍作修改：我使用了p.communicate("INPUT_FILE1\nINPUT_FILE2")，没有\r。 @Armin-Rigo 建议的 communicate 和 stdin.write 有什么区别？或者这是一个不同的问题......
在这种情况下，它应该等同于.stdin.close(); .wait()。不同之处可能在于最初的.write() 部分。
虽然looking at the source I don't see any difference 除了bufsize=1（行缓冲）和close_fds=True（后者应该是posix的默认值）

【解决方案2】：

不久前我遇到了类似的问题，结果证明是添加了一个小暂停。看看this，看看该技术是否有帮助。

【讨论】：

【解决方案3】：

这可能是由使用shell=True 调用的shell 引起的，如果它没有在您的系统上调用bash。您可以避免依赖扩展的 shell 语法 <<，而是自行构建整个调用，如下所示：

popen = subprocess.Popen(["/path/to/FORTRAN/program"], stdin=subprocess.PIPE)
popen.stdin.write('123\n')
time.sleep(0.1)    # hack, following LAK's suggestion
popen.stdin.write('456\n')
popen.stdin.close()
result = popen.wait()

【讨论】：

我已经尝试了您更新的建议 - 并稍微使用了 sleep 命令 - 没有成功。现在我通过将命令写入 shell 脚本并从 Python 执行它来修复它。也许有点令人费解，但它确实有效。