使用 python 运行 bash_profile 命令答案

【问题标题】：Running bash_profile commands with python使用 python 运行 bash_profile 命令
【发布时间】：2019-01-17 11:23:13
【问题描述】：

在我的 bash 终端中，我可以运行以下命令：

$SCHRODINGER/run volume_calc.py -imae type.mae

这可以正常工作。

然后我尝试在 python 脚本中运行相同的命令；我尝试过以下方法：

import subprocess
subprocess.run(['$SCHRODINGER/run', 'volume_calc.py', '-imae', 'type.mae'])

引发错误：

FileNotFoundError: [Errno 2] No such file or directory: '$SCHRODINGER/run'

我很困惑问题可能是什么，因为我可以正常运行基本的 bash 命令。感谢您的帮助。

【问题讨论】：

【解决方案1】：

默认情况下不使用 subprocess 完成环境变量扩展，除非您将 shell 参数传递给 subprocess.run 调用。这会将您的参数传递给 shell（例如 bash），该 shell 将处理所需的扩展和任何其他类似 shell 的功能。

这里是必要的代码更改：

subprocess.run(['$SCHRODINGER/run', 'volume_calc.py', '-imae', 'type.mae'], shell=True)

请注意，使用 python 文档中给出的 security considerations 是值得阅读的。

【讨论】：