【发布时间】:2020-10-16 12:33:07
【问题描述】:
我有一个像这样的基因列表保存在一个变量中:
NOL6
NPPC
NPRL2
NRG1
NT5C1B
NUDT19
OSER1
PAEP
PARD3
PCDHA4
我想grep 将所有这些基因放在另一个相同类型的 txt 列表中。我试过这个:
grep -w "^$genes$" list.txt
问题是它返回给我的基因带有破折号-,类似于 NT5C1B:
NT5C1B-RDH14
但是,如果我单独搜索基因:
grep "^NT5C1B$" list.txt
我不会用破折号获得基因,而只会:
NT5C1B
有没有办法使用grep -w 或其他命令来做到这一点?
【问题讨论】:
-
用
-x替换-w? -
我们还需要在
list.txt中查看一些文本,您的$gene变量中有什么内容?您在第一个代码块中粘贴的单个条目还是所有条目? -
@WiktorStribiżew 我认为这个问题可能很快就结束了......“我不会用破折号获得基因,但只有:......”我猜 OP 希望在结果中得到
Pattern-something。另外,我们没有看到输入文本,我们不知道它是否是-x大小写。无论如何,OP没有清楚地描述需求。
标签: grep