如何从数据框中提取观察结果并制作显示观察结果、列名和行名的表格？

【问题标题】：How to extract observations from a data frame and make a table showing observations, column name, and row name?如何从数据框中提取观察结果并制作显示观察结果、列名和行名的表格？
【发布时间】：2019-02-18 20:16:01
【问题描述】：

我正在尝试从数据框中提取观察结果并创建一个新数据框，该数据框在一列中显示观察结果，在另一列中显示相应列，在另一列中显示相应行。然后消除其中包含 NA 的值。目前df看起来像：

Flask     Well 1      Well 2
  A            NA         NA
  B           2Mg       Control
  C           3Mg       Control
  D           4Mg       Control
  E            NA         NA

我尝试过使用!is.na()，但它不会消除当前状态下的值和结构df。目前我使用chart_df %>% group_by(row.names(chart_df)) 组织了它，但并没有完全正确地组织它。

我想要的是一个看起来像这样的 df：

Condition   Column   Row
NA          Well1      A
2Mg         Well1      B
3Mg         Well1      C
4Mg         Well1      D

【问题讨论】：

标签： r dataframe

【解决方案1】：

我想你在找melt

# the data
my_df <- read.table(text = "Flask     Well_1      Well_2
                     A            NA         NA
                     B           2Mg       Control
                     C           3Mg       Control
                     D           4Mg       Control
                     E            NA         NA", header = TRUE)

library(reshape2)
melt(my_df , id.vars = 'Flask') %>% 
  setNames(c('Row', 'Column', 'Condition')) %>% 
  na.omit()

更新：当id.vars（Flask 列）是rownames时

# the data
my_df <- my_df[c('Well_1',  'Well_2')] %>% 
  as.data.frame(row.names = my_df$Flask) 

my_df %>% 
  as.matrix() %>% melt() %>%  na.omit()

【讨论】：

Flask 列实际上是 df 的行名，并没有注册为 id.vars
作为一种解决方法，您可以在melt 之前使用as.matrix，请查看我的更新
当然！如果您的问题得到解决，请接受答案。