Python：集群入门

Question

我试图了解 python 层次聚类模块中的这个链接函数的作用（无法从文档或其他更复杂的问题中理解）。

我尝试了一个带有随机向量的示例。我不知道从哪里开始弄清楚这是在做什么，为什么链接中有 12 个数字，它们是什么？

谢谢

dist_vec=np.random.randint(1,10,6)
print dist_vec
[4 2 2 6 5 1]

# create linkage
Z = linkage(dist_vec, method='single')

# distance = 0.8 as cutoff
clusters = fcluster(Z, 0.8, criterion='distance')

print Z
[[ 2.  3.  1.  2.]
[ 0.  4.  2.  3.]
[ 1.  5.  4.  4.]]

Answer 1

输出格式在 scipy 文档中有说明。

这是两个集群 ID，高度和点数。

我强烈建议从二维欧几里得玩具数据开始。不是随机距离矩阵（会不一致）。