如何在 Jenkins 上激活 conda 环境

Question

我已经看到this 的问题，但我运行的是 RHEL 7.3，而不是 Windows。

使用这个简单的 Jenkins shell 脚本：

#!/bin/bash
echo $PATH
echo $HOME
source /app/local/anaconda3/bin/activate py35_myenv

我遇到了这个失败：

$ /bin/bash /tmp/jenkins5945453203311093000.sh
/sbin:/usr/sbin:/bin:/usr/bin:/opt/teradata/client/15.10/bin:/app/local/anaconda3/bin:/opt/teradata/client/15.10/bin:/app/local/anaconda3/bin
/home/jenkins
/tmp/jenkins5945453203311093000.sh: line 4: /app/local/anaconda3/bin/activate: Permission denied

我尝试将chmod/app/local/anaconda3/bin/activate 文件设置为 664（最初是 660），但这并没有帮助。也试过chmod -R o+rx /app/local/anaconda3/envs/py35_myenv（那里的可执行文件原来是770，现在是775）。那也没有帮助。我尝试这样做的原因是因为我收到“权限被拒绝”投诉，并且这台机器上的 jenkins 用户不属于这些 Anaconda 文件所在的组。

根据here 的建议，我尝试将#!/bin/bash 添加到我的 Jenkins 脚本的开头，但这没有帮助。

普通的非 Jenkins 用户可以很好地激活这个 conda 环境。我正在尝试让 Jenkins 在此环境之外运行自动化脚本，但我无法在 Jenkins 作业中激活它。

编辑：如果我不提供activate 的完整路径，我会收到“激活：没有这样的文件或目录”的投诉。

编辑：activate 的原因 chmod 为 664（不可执行）在 this answer 中说明。 activate 必须是不可执行的，并且通过 source 运行，以便它可以对环境进行更改。

Jenkins 版本：2.129-1.1

Answer 1

chmod664 不给你执行权限。您可以在chmod 命令中明确指定要授予或撤消哪些权限。它更具可读性。尝试将您的脚本更改为以下内容：

#!/bin/bash
echo $PATH
echo $HOME
/app/local/anaconda3/bin/activate py35_myenv
chmod ug+x /app/local/anaconda3/bin/activate

您可以使用https://chmodcommand.com 来验证该命令是否符合您的预期。

此外，如果jenkins 用户无权访问脚本的父文件夹之一，这可能是一个问题。尝试为父文件夹设置相同的权限。以下命令来自您在 cmets 中的代码 sn-p：

sudo find . -perm 770 -exec chmod o+rx {}; \
sudo find . -perm 750 -exec chmod o+rx {}; \
sudo find . -perm 660 -exec chmod o+r {}; \
sudo find . -perm 640 -exec chmod o+r {}

Answer 2

在 Jenkins 的 Executed shell 中添加以下行，因为 bash shell 不支持conda init。

export PATH=/path/to/anaconda3/bin:$PATH # modify this path 
eval "$(conda shell.bash hook)"
conda activate your_env # change your_env based on your env name