Rmarkdown 无法正确重现 bash 代码

Question

我正在使用 Rmarkdown 来显示一些 bash 代码：

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title: "Untitled"
author: "JPD"
date: "20 December 2016"
output: html_document
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```{r setup, include=FALSE}
knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE)
```

```{r gp.setup, engine= 'bash', eval=FALSE}

##Change names to remove dots
g.rename raster=gp_ortho.1,gp_ortho_1,gp_ortho.2,gp_ortho_2,\
gp_ortho.3,gp_ortho_3

##Group bands together
i.group --verbose group=gp_combo input=gp_ortho_1@gp1,gp_ortho_2@gp1,\
gp_ortho_3@gp1
```

但是，当编织成 html 时，g.rename 行大多会消失。为了比较，下面的 i.group 命令显示正确：

执行此操作的 g.rename 代码行是什么？是. 吗？

Answer 1

bash 将点/句点 (.) 视为执行后续内容的命令，因此它不是打印文字字符，而是查找名为 1、2 和 3 的文件。

我没有设置 GRASS 以在不启动会话的情况下工作，但我猜如果你这样做，你的脚本会正确解释 g.rename 命令并查找你指定的光栅文件。

我假设 GRASS 未在您的 Rmarkdown 文件中设置，因此它只是打印 g.rename... 字符，然后将 . 视为要执行的文件，因此不打印以下内容。要使其正确打印，请在文件名中使用 . 以外的其他内容，设置 Rmarkdown 会话以将 g.rename 理解为命令，或使用 \ 转义字符：

```{r gp-setup, engine="bash", eval=FALSE}
# Change names to remove dots

g.rename raster=gp_ortho\.1,gp_ortho_1,gp_ortho\.2,gp_ortho_2, \
gp_ortho\.3,gp_ortho_3

## Group bands together
i.group --verbose group=gp_combo input=gp_ortho_1@gp1,gp_ortho_2@gp1, \
gp_ortho_3@gp1
```