为什么 VS Code 调用错误的虚拟环境作为基础？

Question

我每天通过 SSH 连接到的服务器中有一些 conda 虚拟环境。从终端登录并列出环境给了我以下信息：

(base) [rgr6291@klc0201 ~]$ conda env list
# conda environments:
#
fomc                     /home/rgr6291/.conda/envs/fomc
r_conda                  /home/rgr6291/.conda/envs/r_conda
rfe_paper                /home/rgr6291/.conda/envs/rfe_paper
base                  *  /software/python-anaconda3/2019.10

所以我有基础环境和三个虚拟环境。我通常使用 Visual Studio Code 和远程 SSH 扩展在服务器上编辑代码。当提示我选择 Python 解释器时，VS Code 会识别所有这些环境：

事实证明，无论我是否在 fomc 环境中，从 VS Code 启动终端窗口都会导致不同的行为。

如果我选择 rfe_paper 环境并使用 VS Code 启动一个新终端，我会得到以下自动输出：

source activate rfe_paper
(base) [rgr6291@klc0201 HF_FOMC]$ source activate rfe_paper
(rfe_paper) [rgr6291@klc0201 HF_FOMC]$ 

它启动终端，然后激活所需的环境。但是，fomc 环境中的相同过程会导致不同的结果：

source /home/rgr6291/.conda/envs/fomc/bin/activate
(base) [rgr6291@klc0201 HF_FOMC]$ source /home/rgr6291/.conda/envs/fomc/bin/activate
(base) [rgr6291@klc0201 HF_FOMC]$ conda activate fomc

(base) [rgr6291@klc0201 HF_FOMC]$ conda env list
# conda environments:
#
base                  *  /home/rgr6291/.conda/envs/fomc
r_conda                  /home/rgr6291/.conda/envs/r_conda
rfe_paper                /home/rgr6291/.conda/envs/rfe_paper

请注意，开头有一个额外的source 调用。不知何故，VS Code 被误导并认为fomc 环境是基础环境。

1. 可能是什么原因造成的？
2. 如何解决这个问题？

昨天运行良好，但今天似乎坏了。唯一的不同是我今天早上将fomc中安装的包导出到了一个yml文件。我不知道这会如何影响行为。

顺便说一下，我也报告以下内容。这是~/.conda/envs/fomc/bin/activate的内容：

#!/bin/sh
_CONDA_ROOT="/home/rgr6291/.conda/envs/fomc"
# Copyright (C) 2012 Anaconda, Inc
# SPDX-License-Identifier: BSD-3-Clause
\. "$_CONDA_ROOT/etc/profile.d/conda.sh" || return $?
conda activate "$@"

我认为 CONDA_ROOT 是错误的，但我不知道它实际上应该是什么。

提前致谢。

Answer 1

⚠️ 注意： 这是未经测试的建议。在尝试之前，请确保整个过程清晰。请务必在更改之前备份所有文件！

我个人没有遇到过这种情况，但我怀疑解决它需要从 fomc 环境中删除 conda 包。这可能就足够了；但确保 .bashrc 或 .bash_profile 中的 Conda 初始化代码设置为使用实际的 base 环境而不是 中的脚本/入口点也很重要fomc 环境。

因此，我建议首先检查.bashrc 和.bash_profile，并确保它们没有任何引用fomc 的路径。如果他们这样做，那么整个初始化块，开始和结束

# >>> conda initialize >>>
...
# <<< conda initialize <<<

应该被删除，然后应该重新运行conda init 命令激活真正的base环境，或者使用base的完整路径强>conda.

完成此操作后，重新启动 shell 并验证 conda 是否仍然有效并指向 base（即检查 which conda）。然后尝试从 fomc 中删除 conda 包，这样做 fomc 处于活动状态，即

conda remove -n fomc conda

应该是这样的。