如何将nii图像转换为2D图像？答案

【问题标题】：How to convert nii images to 2D image?如何将nii图像转换为2D图像？
【发布时间】：2021-09-15 19:42:24
【问题描述】：

我有一堆 nii 格式的图像（100 个切片），我想将它们转换为 2D png 格式，以便将它们提供给 2D 模型。

import nibabel as nib
# Read file
scan = nib.load('/path/to/stackOfimages.nii.gz')
# Get raw data
scan = scan.get_fdata()
print(scan.shape)
(128, 128, 100)

图像是 2D png 格式，我将其转换为 nii.gz 以制作一张 3D 图像，现在我想将它们转换回 png 格式。因为我的模型是 2D 模型，所以我想为模型提供一堆切片（每个人 100 个切片）而不是一次一张图像。如下图所示

【问题讨论】：

标签： python image

【解决方案1】：

from PIL import Image
...
for plane in range(scan.shape[2]):
    p = scan[:,:,plane].astype(np.uint8)
    img = Image.fromarray(p)
    img.save( f'plane{plane}.png' )

【讨论】：

感谢蒂姆，但单独保存每张图像我想将扫描内的所有切片转换为一张图像
你打算如何组合切片？你没有指定。
这没有帮助。 CT 扫描由构成 3D 表示的一堆 2D 图像组成，但您不能将 3D 信息存储在 PNG 中。这是不可能的。