使用因子“”删除数据框中的行答案

【问题标题】：Remove rows in dataframe with factor ""使用因子“”删除数据框中的行
【发布时间】：2011-08-17 08:47:27
【问题描述】：

我有一个像 x 这样的数据框，其中列基因是一个因素。我想删除列基因没有的所有行。因此，在表 X 中，我想删除第 4 行。有没有办法为大型数据框执行此操作？

X 
names   values   genes
1 A  0.2876113  EEF1A1 
2 B  0.6681894   GAPDH
3 C  0.1375420 SLC35E2
4 D -1.9063386        
5 E -0.4949905   RPS28

最终结果：

X 
names   values   genes
1 A  0.2876113  EEF1A1 
2 B  0.6681894   GAPDH
3 C  0.1375420 SLC35E2
5 E -0.4949905   RPS28

谢谢大家！

【问题讨论】：

标签： r dataframe

【解决方案1】：

从您的问题中，空值是什么并不完全清楚，但您应该能够采用下面的解决方案（这里我假设“空”值是空字符串）：

toBeRemoved<-which(X$genes=="")
X<-X[-toBeRemoved,]

【讨论】：

【解决方案2】：

@Nick Sabbe 提供了一个很好的答案，但有一个警告：

使用-which(...) 是一个巧妙的技巧，可以（有时）在只有几个元素要删除时加快子集操作。

...但是如果有没有元素要删除，它就会失败！

因此，如果X$genes 不包含任何空字符串，which 将返回一个空整数向量。否定它仍然是一个空向量。 X[integer(0)] 返回一个空的data.frame！

toBeRemoved <- which(X$genes=="")
if (length(toBeRemoved>0)) { # MUST check for 0-length
    X<-X[-toBeRemoved,]
}

或者，如果速度增益不重要，那么简单：

X<-X[X$genes!="",]

或者，正如@nullglob 指出的那样，

subset(X, genes != "")

【讨论】：

很好的警告。也可以是if ( length(toBeRemoved) ) {。进一步观察：使用subset 也会删除所有is.na(X$genes) 为TRUE 的行。