如何按索引对ffdf进行子集化？答案

【问题标题】：How to subset ffdf by index?如何按索引对ffdf进行子集化？
【发布时间】：2017-11-15 23:03:10
【问题描述】：

我想通过索引对一个 ffdf 对象进行子集化，返回另一个 ffdf 对象。

help file on subset.ffdf 表示您可以将范围索引（ri）对象作为参数传递，但是当我尝试时：

data_subset <- subset.ffdf(data, ri(1, 1e5))

我收到了这个错误：

Error in which(eval(e, nl, envir)) : argument to 'which' is not logical

根据 You-Leee 的建议，我尝试使用以下代码传递感兴趣索引的逻辑向量：

n <- length(data[[1]]) #10.5 million
logical_index = c(1, 1e5) == seq.int(1, n)
data_subset <- subset(data, logical_index)

我尝试运行它两次，每次我的 R-Studio 崩溃并显示消息 R encountered a fatal error. The session was terminated. 起初我认为这可能是内存限制，但查看我的活动监视器，我仍然有 8gb 中的 4gb 可用。此外，无论如何，这不应该在内存中加载太多。

【问题讨论】：

subset 的第二个元素需要是一个条件，即一个逻辑向量 (TRUE, FALSE)。您想按索引对列进行子集化吗？
是的，这正是我想要的，按索引子集。

标签： r ff ffbase

【解决方案1】：

参数必须是合乎逻辑的，因此您必须将 TRUE 放在所需的索引上，否则将 FALSE：

> data <- ffdf(a = ff(1:12))
> subset.ffdf(data, c(1, 1e5) == seq.int(1, length(data$a)))
ffdf (all open) dim=c(1,1), dimorder=c(1,2) row.names=NULL
ffdf virtual mapping
  PhysicalName VirtualVmode PhysicalVmode  AsIs VirtualIsMatrix     PhysicalIsMatrix
a            a      integer       integer FALSE           FALSE                FALSE
  PhysicalElementNo PhysicalFirstCol PhysicalLastCol PhysicalIsOpen
a                 1                1               1           TRUE
ffdf data
  a
1 1

【讨论】：

谢谢你的回答，You-lee！请查看我对问题的编辑。
我认为这需要一个新问题，因为致命错误。由于没有其他错误消息，我将首先调试子集函数：'> debug(subset.ffdf)'，然后尽可能深入函数调用以确定引发致命错误的位置。