Cython cimport 找不到 .pxd 模块答案

【问题标题】：Cython cimport cannot find .pxd moduleCython cimport 找不到 .pxd 模块
【发布时间】：2018-02-05 11:16:59
【问题描述】：

已解决，请参阅编辑 #3

假设一个包的结构如下：

Some_Package/ 
    some_package/
        __init__.py
        core/
            __init__.py
            definition.pxd
        helper/
            __init__.py
            helper.pxd
            helper.pyx
    setup.py

definition.pxd 我在哪里：

import numpy as np
cimport numpy as np
# ...
ctypedef np.int32_t INT_t

在helper.pxd 我有：

cimport some_package.core.definition
from some_package.core.definition cimport INT_t
# ...

在helper.pyx 我没有cimport 任何东西。我将setup.py 配置为：

ext_modules=cythonize('./some_package/helper/helper.pyx', include_dirs=['.', './some_package/core'])

现在我的问题是python setup.py build_ext --inplace 我可以成功构建到.so，但是当我尝试import some_package.helper.helper 时，我得到了一个ImportError：

ImportError: No module named "some_package.helper.helper"

我查看了helper.cpp 并发现了一些类似的行：

  __pyx_t_1 = __Pyx_ImportModule("some_package.core.definition"); if (!__pyx_t_1) __PYX_ERR(0, 1, __pyx_L1_error)

我猜这可能与导入路径有关，但我无法发现问题所在。所有__init__.py 都是空的，我在每个文件中都导入了absolute_import。我也改了include_dirs，但还是不行。

编辑#1

根据documentation，include_dirs添加到*.pxd搜索路径。所以我也尝试将helper.pxd中的cimport语句改成：

cimport definition
from definition cimport INT_t

这一次，cython 无法编译："definition.pxd" not found。但是，它应该在搜索路径中。

编辑#2

快速锻炼是在core/ 中添加一个空的definition.pyx，然后将扩展配置为：

extensions = [
    Extension("some_package.core.definition", ["some_package/core/definition.pyx"])
    Extension("some_package.helper.helper", ["some_package/helper/helper.pyx"])
]

然后在setup.py:

ext_modules=cythonize(extensions)

现在cimport some_package.core.definition 在helper.pxd 工作。

然而，这并不优雅。

编辑 3

我终于发现我忽略了一些行，例如：

cdef INT_t some_int = 1

但是，在.pxd 文件中，不能有任何可执行代码。在这种情况下，Cython 似乎将其视为一个包，而不是.pyx 文件。

可能有两种解决方法：

cdef extern 来自 C 标头。
总结内联函数。

【问题讨论】：

等等，你给你的包裹打电话src？我建议先使用不同的名称，因为这只会导致命名冲突。
@MSeifert 谢谢！ src 用于说明目的（因为我发现它很常见）。事实上，src 被命名为 some_package 并被放在名为 Some_Package 的根目录中。
是的，它是src 文件的目录。最后，您从那里获取代码，但将其构建为实际包中的扩展。如果概念发生了变化，那就有点令人困惑了。 :-]
@MSeifert 好的，我已经修复了它们。谢谢。 :)

标签： python cython cythonize

【解决方案1】：

我忽略了一些行：

cdef INT_t some_int = 1

但是，在.pxd 文件中，不能有任何可执行代码。在这种情况下，Cython 似乎将其视为一个包，而不是 .pyx 文件。

可能有两种解决方法：

cdef extern 来自 C 标头。
总结内联函数。

【讨论】：