用于读取 R 中不完整数据的 read.table 函数答案

【问题标题】：read.table function for reading in incomplete data in R用于读取 R 中不完整数据的 read.table 函数
【发布时间】：2014-03-12 21:32:10
【问题描述】：

我有一张大表要读入 R，文件是 .txt 格式。在R中，我使用read.table函数，但是读入有错误，出现如下错误信息：

Error in scan(file, what, nmax, sep, dec, quote, skip, nlines, na.strings,  : 
  line 28 did not have 23 elements

似乎（从第一行算起，不计算我指定的标题skip=），第 28 行中的数据缺少元素。我正在寻找一种通过过滤掉这一行来自动纠正这个问题的方法。目前，我什至无法读取文件，所以我无法在 R 中进行操作......任何建议都非常感谢:)

【问题讨论】：

标签： r read.table

【解决方案1】：

这是我的做法：使用选项fill=TRUE 调用read.table，然后排除未填写所有字段的行（调用count.fields）。

例子：

# 1. Data generation, and saving in 'tempfile'
cat("1 John", "2 Paul", "7 Pierre", '9', file = "tempfile", sep = "\n")

# 2. read the data:
data = read.table('tempfile',fill=T)

# 3. exclude incomplete data
c.fields = count.fields('tempfile')
data = data[ - (which(c.fields) != max(c.fields)),]

（编辑自动获取行数）

【讨论】：

【解决方案2】：

当您的数据中有井号 (#) 时也会发生该错误。

如果是这种情况，只需将选项 comment.char 更改为 comment.char = ""

read.table("file.txt", comment.char = "")

【讨论】：