【问题标题】:Python CSV Import taking too much time after first 200k rowsPython CSV 导入在前 20 万行之后花费了太多时间
【发布时间】:2019-09-18 23:58:22
【问题描述】:

我有一个导入 CSV 的 python 导入脚本。 将 20k 行导入 mysql 数据库大约需要 45 秒。 问题是现在我有一个巨大的文件(400 万行),当它到达文件的 ~200k 行时,导入相同的 20k 行需要大约 200 秒。

我不知道这是数据库问题还是文件本身正在读取...这是我的脚本:

import csv
import mysql.connector
from mysql.connector import Error
import argparse
from itertools import islice

parser = argparse.ArgumentParser()
parser.add_argument('file', type=argparse.FileType('r'))
args = parser.parse_args() 



def parseData(row):
    sql = """INSERT INTO TABLE 
    (column1,column2) 
    VALUES( '%s','%s');""" % (
        row['col1'],row['col2'],) 


    return sql


def dataImport(filename,connection,cursor):
        data = csv.DictReader(filename,delimiter=';')
        i = 0 
        for row in data:
            sql = parseData(row)
            try:
                result = cursor.execute(sql)
                pass
            except Error as e:
                    pass 

            if i%20000 == 0: 
                connection.commit()

            i=i+1

def importa(file):

    try:
        connection = mysql.connector.connect(host=host,
                                            database=db,
                                            user=user,
                                            password=password)

        if connection.is_connected():
            db_Info = connection.get_server_info()
            print("Connected to MySQL Server version ", db_Info)

            cursor = connection.cursor()
            dataImport(file,connection,cursor)

            cursor.close()


    except Error as e:
        print("Error while connecting to MySQL", e)


if __name__ == "__main__":
    importa(args.file)

【问题讨论】:

  • 使用executemany 进行 20K 行的单次插入而不是提交 20K 插入语句可能会有所帮助。我不使用 mysql,但我发现类似的方法可以加速 PostgreSQL。执行此操作的代码略超出本页的中间部分。 pynative.com/python-mysql-insert-data-into-database-table
  • @Deepstop 感谢您的建议,我会尝试并告诉您
  • @Deepstop 它确实大大提高了我的导入速度(现在 20k 需要 4 秒!),但是对于 ~200k 之后的行,20k 需要大约 2500 秒....有什么想法吗?
  • 可能与索引有关?您可以将 TABLE 的架构添加到您的帖子中吗?此外,如果您将每个 200K 块移动到 executemany 之前的列表中,那么您可以使用 time.time() 来确定是慢速的 csv 文件还是 insert,但我怀疑是后者。但是,我是否也可以建议,除非有令人信服的理由,否则停止使用 DictReader 并仅使用带有数字索引的 reader,如果您还没有这样做的话,这应该会减少客户端的一些开销。
  • 现在的问题出在数据库上,它滞后于那一千行......有趣的是,当文件开始处理时它并没有滞后,即使表量很大...... ..奇怪....我用时间来衡量交易时间,tks!

标签: python mysql import-csv


【解决方案1】:

使用 executemany 执行 20K 行的单次插入而不是 20K 单独的 INSERT 语句将优化传输,但数据库本身也可能是导致性能下降的一个因素。在this page 中间有一个代码示例。

根据我们交换的cmets,数据库是性能缓慢的最终罪魁祸首。我看到的一个想法是在加载所有内容之前禁用索引。

ALTER TABLE table DISABLE KEYS;
... executemany called a bunch of times...
ALTER TABLE table ENABLE KEYS;

这可能值得一试。

【讨论】:

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