bash 以捕获特定的模式实例并排除其他模式答案

【问题标题】：bash to capture specific instance of pattern and exclude othersbash 以捕获特定的模式实例并排除其他模式
【发布时间】：2018-10-11 13:22:15
【问题描述】：

我正在尝试捕获并读入 $line 中的一行或多行 file 中只有 del 的行（第 2 行是一个示例）。第 3 行有del，但它也有ins 和bash，当当前执行时捕获两者。我不知道如何排除除del 之外的任何内容，并且只捕获这些行。谢谢你:)。

文件

NM_003924.3:c.765_779dupGGCAGCGGCGGCAGC
NM_003924.3:c.765_779delGGCAGCGGCGGCAGC
NM_003924.3:c.765_779delGGCAGCinsGGCGGCAGC
NM_003924.3:c.765_779insGGCAGCGGCGGCAGC

期望的输出

NM_003924.3:c.765_779delGGCAGCGGCGGCAGC

带有当前输出的bash

while read line; do
  if [[ $line =~ del ]] ; then echo $line; fi
done < file

NM_003924.3:c.765_779delGGCAGCGGCGGCAGC
NM_003924.3:c.765_779delGGCAGCinsGGCGGCAGC

【问题讨论】：

标签： bash awk sed grep

【解决方案1】：

请您尝试关注（如果可以，awk）。

awk '/del/ && !/ins/'  Input_file

【讨论】：

【解决方案2】：

试试：

while read -r line; do
    [[ $line =~ del && ! $line =~ ins ]] && printf '%s\n' "$line"
done < file

修改后的代码也是ShellCheck干净，避免BashPitfall #14。

如果文件中的最后一行没有终止换行符，此解决方案可能会失败。如果这是一个问题，请参阅Read last line of file in bash script when reading file line by line 接受的答案以获得修复。

【讨论】：

【解决方案3】：

这是一个sed 解决方案。它否定匹配 del 后跟 ins 并打印其中包含 del 的所有内容。 -n 静默所有其他输出。

$ sed -n -e '/del.*ins/!{/.*del.*/p}' inputFile
NM_003924.3:c.765_779delGGCAGCGGCGGCAGC

【讨论】：

谢谢大家的帮助和解释:)。

【解决方案4】：

这是另一个使用启用 PCRE 的答案grep。这应该与GNU grep 中的-P 选项一起使用

$ grep -P 'del\.*(?!.*ins)' inputFile
NM_003924.3:c.765_779delGGCAGCGGCGGCAGC

【讨论】：

先有ins的记录怎么样，比如111_ins_222_del

【解决方案5】：

分两步。你不需要循环：

grep "del" file | grep -v "ins"

【讨论】：