疏浚子集交互次数 (MuMIn)

Question

我尝试在全局模型上使用MuMIn::dredge() 来给我我的候选模型，给定某些标准。我已经阅读了?dredge 并理解了其中的一些内容，但我仍然对如何包含我的标准之一存有疑问：

如果我有一个全局模型，例如

y ~ X1 + X2 + X3 + X4 + X5 + X6 + X7 + X1:X2 + X2:X3 + X3:X4 + X4:X6 + X5:X7

（几个主效应和几个交互） 并且我想指定我只希望 dredge 一次返回包含 一个 交互的模型，我如何以简单的方式对其进行子集化？

另外，如果全局模型还包括一个参数的二次多项式

Y ~ X1 + X1^2 + X2 + X3 + X4

我想指定这两个应该始终一起存在于模型中（主效应X1 永远不会单独没有X1^2）我理解的语法是（同意？）：

dredge(global.model, subset=(X1^2|!X1))

如果我理解正确，dredge() 正在处理相反的问题（X1^2 仅在模型中出现 X1 时才会出现在模型中 - 对于没有任何情况下永远不会发生的交互也是如此存在的主要影响）？

但是dredge() 中的二次多项式的语法是怎样的？我是这样的吗：

dredge(global.model, subset=({I(X1^2)}|!X1))

?

Answer 1

不是最优雅的解决方案，但它有效：

library(MuMIn)

# example global model with many interactions:
fm <- lm(y ~ (X1 + X2 + X3 + X4)^2, Cement, na.action = na.fail)

# create a vector of interaction term names:
x <- c(getAllTerms(fm))
x <- x[grep(":", x)] # won't work if any variable name has ":" in it.

# create a subset expression (sum of interactions < N):
ss <- substitute(sum(X) < N, list(N = 3, X = as.call(lapply(c("c", x), as.symbol))))

# the resulting expression is:
sum(c(`X1:X2`, `X1:X3`, `X1:X4`, `X2:X3`, `X2:X4`, `X3:X4`)) < 3

dd <- dredge(fm, subset = ss)

# verify:
max(rowSums(!is.na(dd[, x]))) # --> 2

编辑：更好的交互检测，并封装到函数中：

subsetExprInteractionLimit <- function(model, N = 1) {
    x <- getAllTerms(model)
    x <- c(x)[attr(x, "order")][attr(terms(model), "order") > 1]
    substitute(sum(X) <= N, list(N = N, X = as.call(lapply(c("c", x), as.symbol))))
}

subsetExprInteractionLimit(fm, N = 1) # limit to 1 interaction