在作业脚本中加载 R 包

Question

我确定这是一个简单的问题，但我一直无法弄清楚。我想向统计计算中心提交作业，我使用的脚本如下：

#!/bin/sh 
#PBS -l nodes=1
#PBS -l walltime=1:00:00
module add R/2.14.0
R
packages.install("np")
61
library(np)
packages.install("foreign")
library(foreign)
data<-read.dta("smallsample.dta")

...

然后有更多命令使用 R 中的 np 包。注意：61 行用于安装包时请求的国家特定镜像。当我提交脚本时，我立即收到包含packages.install("np") 的行的错误。如何在 R 中安装软件包？我试图准确地复制交互式会话中的工作原理，但我没有成功。

Answer 1

您必须使用install.packages 而不是packages.install。要设置存储库，您必须使用 repos 参数。我怀疑像这样输入它会起作用，但不确定。