解释多线程程序的 Linux 时间命令结果 (%CPU > 100)答案

【问题标题】：Interpreting Linux time command result for a multi-threaded program (%CPU > 100)解释多线程程序的 Linux 时间命令结果 (%CPU > 100)
【发布时间】：2013-02-23 10:31:35
【问题描述】：

我想在我的服务器上对 BLAST 运行时间进行基准测试，因此我启动了 time 命令。服务器有 16 个 CPU，我正在运行 BLAST 16 线程。在我进行分析时，可能还有其他应用程序在并行运行。

输出如下：

184255.45user 458.23system 6:37:54elapsed 773%CPU (0avgtext+0avgdata 83504272maxresident)k
294680inputs+10029344outputs (1799major+149694417minor)pagefaults 0swaps

将用户时间解释为 CPU 运行我的应用程序所花费的秒数，我得到的时间超过了总时间。我看到有人告诉我应该用 %CPU 来划分时间，但我只得到了 3 分钟，这对于 BLAST 和我放入的大小的输入是不现实的。

我需要的信息是用户时间，但我不知道如何解释。

对结果的解释有什么建议吗？

【问题讨论】：

完全相切（但可能相关）的问题：这是一个集群吗？
你做错了数学。 184255.45 ÷ 773% = 23800，或大约 400 分钟。
仅供记录（除了@DietrichEpp 的评论）：您必须将百分比除以100，否则您无法使用它们进行计算。 184,255.45s ÷ (773% ÷ 100) ≈ 23,836.41s23,836.41s ÷ 60 ≈ 400min

标签： linux time benchmarking blast

【解决方案1】：

来自手册页（取自here）：

The default format is:

    %Uuser %Ssystem %Eelapsed %PCPU (%Xtext+%Ddata %Mmax)k
    %Iinputs+%Ooutputs (%Fmajor+%Rminor)pagefaults %Wswaps

因此，184255 秒在用户空间中花费，458 秒在内核空间中，6 小时 37 分 54 秒经过了“真实”时间.

正如 Dietrich Epp 在他的评论中指出的那样，看看经过的时间，他们匹配，6:37:53 是 397.8833 分钟。

Here's 很好地解释了user/system/real(elapsed) 时间的区别：

Real 是挂钟时间 - 从通话开始到结束的时间。这是所有经过的时间，包括其他进程使用的时间片以及进程阻塞的时间（例如，如果它正在等待 I/O 完成）。

User 是进程内用户模式代码（内核外部）所花费的 CPU 时间量。这只是实际使用的 CPU 时间执行过程。其他流程和流程花费的时间被阻止不计入这个数字。

Sys 是进程内在内核中花费的 CPU 时间量。这意味着执行系统调用所花费的 CPU 时间内核，而不是仍在运行的库代码用户空间。像“用户”一样，这只是进程使用的 CPU 时间。请参阅下面的内核模式的简要说明（也称为 'supervisor'模式）和系统调用机制。

【讨论】：