收到 Python 错误“来自：无法读取 /var/mail/Bio”答案

【问题标题】：Getting Python error "from: can't read /var/mail/Bio"收到 Python 错误“来自：无法读取 /var/mail/Bio”
【发布时间】：2013-04-17 20:37:12
【问题描述】：

我正在运行导致以下错误的 (bio)python 脚本：

from: can't read /var/mail/Bio

看到我的脚本与邮件没有任何关系，我不明白为什么我的脚本在 /var/mail 中查找。

这里似乎有什么问题？我怀疑它会有所帮助，因为脚本似乎不是问题，但无论如何这是我的脚本：

from Bio import SeqIO
from Bio.SeqUtils import ProtParam

handle = open("examplefasta.fasta") 
for record in SeqIO.parse(handle, "fasta"): 
    seq = str(record.seq)
    X = ProtParam.ProteinAnalysis(seq)
    print X.count_amino_acids() 
    print X.get_amino_acids_percent() 
    print X.molecular_weight() 
    print X.aromaticity() 
    print X.instability_index() 
    print X.flexibility() 
    print X.isoelectric_point() 
    print X.secondary_structure_fraction()

这里有什么问题？糟糕的python设置？我真的不认为这是脚本。

【问题讨论】：

标签： python

【解决方案1】：

不，这不是脚本，而是您的脚本根本没有被 Python 执行。如果您的脚本存储在一个名为script.py 的文件中，您必须将其作为python script.py 执行，否则默认shell 将执行它并在from 关键字处退出。（顺便说一下，from 是一个命令行实用程序的名称，它打印向给定用户名发送邮件的人的姓名，这就是它尝试访问邮箱的原因。

另一种可能性是在脚本顶部添加以下行：

#!/usr/bin/env python

这将指示您的 shell 通过 python 执行脚本，而不是尝试自行解释它。

【讨论】：

是的，除非python 位于其他地方。我更喜欢使用基于env的解决方案，因为它只是在用户的默认路径中查找Python。
嗯...我从没听说过。非常真实。
非常好 - 感谢您指出我的男生错误。我正在从在 python 命令提示符下输入转换为执行脚本。
谢谢。我不是 python 编码员，但我必须为我的任务做这个。

【解决方案2】：

我遇到了类似的错误

“来自：无法读取 /var/mail/django.test.utils”

尝试运行命令时

>>> from django.test.utils import setup_test_environment
>>> setup_test_environment()

在https://docs.djangoproject.com/en/1.8/intro/tutorial05/的教程中

阅读 Tamás 的回答后我意识到我不是在 python shell 中而是在终端中尝试这个命令（这可能发生在那些刚接触 linux 的人身上）

解决方法是先用命令python进入python shell 当你得到这些>>> 然后运行任何 python 命令

【讨论】：

【解决方案3】：

这里也一样。在 django 项目中从终端运行导入命令而没有通过 manage.py 激活 python3 shell 时出现此错误（是的，我还是个新手）。正如人们所预料的那样，激活 shell 可以正确解释命令。

./manage.py shell

只有这样

>>> from django.contrib.sites.models import Site

【讨论】：

【解决方案4】：

把它放在你的 .py 文件的顶部（对于 python 2.x）

#!/usr/bin/env python

或者对于 python 3.x

#!/usr/bin/env python3

这应该查找 python 环境，没有它，它将像不是 python 代码一样执行代码，而是直接到 CLI。如果需要手动指定python环境put的位置

#!/#path/#to/#python

【讨论】：

【解决方案5】：

我遇到了同样的错误，因为我试图继续运行

XXX-Macmini:Python-Project XXX.XXX$ from classDemo import MyClass

from: can't read /var/mail/classDemo

要解决这个问题，输入命令 python 当你得到这些 >>> 然后运行任何 python 命令

>>>from classDemo import MyClass
>>>f = MyClass()

【讨论】：

【解决方案6】：

对于 Mac OS，只需转到应用程序并运行这些脚本 Install Certificates.command 和 Update Shell Profile.command，现在它就可以工作了。

【讨论】：