如果分数都是 1，什么控制 scispacy 中的 UMLS 链接实体的顺序答案

【问题标题】：what controls the order of UMLS linked entities from scispacy if the scores are all 1如果分数都是 1，什么控制 scispacy 中的 UMLS 链接实体的顺序
【发布时间】：2021-06-22 06:02:31
【问题描述】：

我正在使用 Scispacy（太棒了！）但是当我在此处找到的应用程序中输入“tau”时 https://scispacy.apps.allenai.org/ UMLS 实体为我提供了我想要的“MAPT 基因”的规范名称。但是当我基于应用程序代码在我的 python 代码中做完全相同的事情时（见这里https://gist.github.com/DeNeutoy/b20860b40b9fa9d33675893c56afde42）列表中的第一个规范名称是“三乙酸尿苷”（第二个是“MAPT 基因”）

在应用程序代码中有调用'if show_only_top:break'，所以我假设他们的应用程序实现以不同方式对链接实体进行排序。

如果有人可以解释订购的差异以及如何解决，将非常感谢！

【问题讨论】：

标签： spacy allennlp entity-linking

【解决方案1】：

这个问题也在 github (https://github.com/allenai/scispacy/issues/344) 上被问到，并在那里得到了回答，但我在下面提供了答案，以防有人在这里结束。

演示应用当前未运行最新版本的 scispacy，实体排序不一致是 scispacy 版本 0.4.0 中修复的问题。

【讨论】：