MPI矩阵乘法答案

【问题标题】：MPI matrix multiplicationMPI矩阵乘法
【发布时间】：2018-09-08 20:51:04
【问题描述】：

我正在尝试制作一个 MPI 矩阵乘法程序，但 scatter 函数似乎对我不起作用。只有一排分散，其余核心收到垃圾值。

在我之前调用 display_matrix() 函数时，我 MPI_Init() 似乎正在运行 4 个线程而不是 1 个（我有四核 CPU）。为什么甚至在初始化之前就会发生这种情况？

#include <stdio.h>
#include <stdlib.h>
#include <time.h>
#include<mpi.h>

int **matrix_generator(int row,int col);
int **multiply_matrices(int **matrix_A,int **matrix_B,int rowsA, int colsA,int rowsB,int colsB);
void display_matrix(int **matrixA,int rows,int cols);

void main(int argc,char *argv[])
{
    srand(time(0));

    int **matrix_A,**matrix_B,**matrix_result,*scattered_matrix,*gathered_matrix, rowsA,colsA,rowsB,colsB,world_rank,world_size,i,j;

    rowsA = atoi(argv[1]);
    colsA = atoi(argv[2]);
    rowsB = atoi(argv[3]);
    colsB = atoi(argv[4]);

    scattered_matrix = (int *)malloc(sizeof(int) * rowsA*colsA/4); 

    if (argc != 5)
    {
        fprintf(stderr,"Usage: mpirun -np <No. of processors> ./a.out <Rows A> <Columns A> <Rows B> <Columns B>\n");
        exit(-1);
    }
    else if(colsA != rowsB)
    {
        printf("Check the dimensions of the matrices!\n\n");
    }

    matrix_A = matrix_generator(rowsA,colsA);
    matrix_B = matrix_generator(rowsB,colsB);

    display_matrix(matrix_A,rowsA,colsA);

    MPI_Init(&argc, &argv);

    MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &world_rank);
    MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, &world_size);

    MPI_Scatter(matrix_A, rowsA*colsA/4, MPI_INT, scattered_matrix, rowsA*colsA/4, MPI_INT, 0, MPI_COMM_WORLD);

    for(i=0;i<world_size;i++)
    {  
        printf("Scattering data %d from root to: %d \n",scattered_matrix[i],world_rank);
    }

    MPI_Barrier(MPI_COMM_WORLD);

    MPI_Finalize();
}

int **matrix_generator(int row, int col)
{
    int i, j, **intMatrix;

    intMatrix = (int **)malloc(sizeof(int *) * row); 

    for (i = 0; i < row; i++)
    {
        intMatrix[i] = (int *)malloc(sizeof(int *) * col);
        for (j = 0;j<col;j++)
        {
            intMatrix[i][j]=rand()%10;
        }
    }
    return intMatrix;
}

void display_matrix(int **matrix, int rows,int cols)
{
    int i,j;
    for (i = 0; i < rows; i = i + 1)
    {
        for (j = 0; j < cols; j = j + 1)
            printf("%d ",matrix[i][j]);
        printf("\n");
    }
}

【问题讨论】：

欢迎来到 Stackoverflow！矩阵的分配方式，一次一行，使其在内存中不连续，例如参见stackoverflow.com/questions/25628321/…。此外，matrix_A 是指向行的指针，而 MPI_Scatter() 需要指向要分散的缓冲区的指针。因此，请尝试 MPI_Scatter(matrix_A[0],...) 或 MPI_Scatter(&matrix_A[0][0],...)
如您所见，我有一个可变大小的矩阵。如何将连续内存分配给可变大小的数组？

标签： c parallel-processing mpi

【解决方案1】：

主要问题是您的矩阵未分配在连续内存中（请参阅评论部分的链接）

MPI 标准没有指定在应用调用 MPI_Init() 之前会发生什么。

两个主要的 MPI 实现选择在调用 mpirun 时生成所有任务（这意味着首先有 4 个独立进程，当它们都调用 MPI_Init() 时它们“加入”到单个 MPI 作业中）。话虽如此，曾几何时，供应商选择让 mpirun 启动单个 MPI 任务，并在调用 MPI_Init() 时使用自己的远程分叉。

归根结底，如果您想编写可移植代码，请在调用 MPI_Init() 之前尽可能少做（并且永远不要打印任何内容）。

【讨论】：