一生颠倒

Question

我正在使用lifelines library 学习生存分析。我正在使用leukemia dataset。我试图绘制生命周期图。但是，我得到了一个颠倒的图（即垂直翻转）。

我使用这个notebook 作为参考。这是我的代码：

import lifelines
import matplotlib.pyplot as plt
from lifelines.datasets import load_leukemia
leukemia = load_leukemia()
durations = leukemia.t.values
events = leukemia.status.values
ax = lifelines.plotting.plot_lifetimes(durations=durations, event_observed=events)
ax.set_xlim(0, 40)
ax.set_xlabel("Time in Months")
plt.plot()

这是我得到的情节

这是我要生成的情节：

Answer 1

虽然我不确定哪一个图是正确的，但lifelines API 已于 2019 年 3 月 21 日更新（v. 0.20.2）。根据changelog：

plot_lifetimes 在绘图时不再颠倒顺序。

github 笔记本的日期为 2019 年 3 月 11 日，因此我认为它使用的是旧 API，这会导致图中所示的情节。但是，lifelines 的所有未来版本都会导致您得到的情节。

所以基本上如果你卸载当前的lifelines 包和pip install lifelines==0.24.13（v. 0.24.13 是最新的lifelines 版本）你会得到你得到的情节。

Cameron Davidson (lifelines author) 可能会对此有所了解 - 白血病数据集可能需要在 API 更改后更新！