【发布时间】:2015-10-29 15:47:09
【问题描述】:
简介
我正在用 inline-c 包装一个 C 数值库;一些函数可以通过回调传递给步骤例程,考虑 ODE 的优化或时间集成。
特别是在原生 C 语言中,回调可以对连续数组进行操作,通过指针修改它们,并将它们返回到一些不透明(分布式)数据结构。
所以这是一个可变数据问题,我想在 Haskell 方面表示它:据我了解,在回调中我们应该冻结数组,例如处理它作为Data.Vector.Storable.Vector 或repa,解冻结果,获取外部指针并将其传回。
内部结构:newtype Vec = Vec (Ptr Vec) deriving Storable 和 inline-c 上下文中的关联条目表示指向不透明 C 数据结构的指针的类型,vecGetArray/vecRestoreArray 生成/请求指向连续内存的相同指针并分别请求/生成Vec。
问:
我注意到,虽然返回的Vector 是正确的,但当我使用结果时,修改了Vec(“副作用”),从这个函数返回后,它没有被修改。 GHC 不会重新计算它(懒惰?)。我如何让它重新计算它? Haskell 中有什么惯用的方式来处理跨 FFI 的可变数据?
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谢谢!
import qualified Data.Vector.Storable as V
import qualified Data.Vector.Storable.Mutable as VM
withVecGetVectorM ::
Vec ->
(V.Vector PetscScalar_ -> IO (V.Vector PetscScalar_)) ->
IO (V.Vector PetscScalar_)
withVecGetVectorM v f = do
p <- vecGetArrayPtr v
pf <- newForeignPtr_ p
vImm <- V.freeze (VM.unsafeFromForeignPtr0 pf len)
vImmOut <- f vImm
vMutOut <- V.thaw vImmOut
let (fpOut, _, _) = VM.unsafeToForeignPtr vMutOut
pOut = unsafeForeignPtrToPtr fpOut
vecRestoreArrayPtr v pOut
return vImmOut
where len = vecSize v
Vec.hs:
vecGetArrayPtr :: Vec -> IO (Ptr PetscScalar_)
vecGetArrayPtr v = chk1 (vecGetArrayPtr' v)
vecRestoreArrayPtr :: Vec -> Ptr PetscScalar_ -> IO ()
vecRestoreArrayPtr v ar = chk0 (vecRestoreArrayPtr' v ar)
InlineC.hs
-- PETSC_EXTERN PetscErrorCode VecGetArray(Vec,PetscScalar**);
vecGetArrayPtr' :: Vec -> IO (Ptr PetscScalar_, CInt)
vecGetArrayPtr' v = withPtr $ \p -> vga v p where
vga v p = [C.exp|int{VecGetArray($(Vec v), $(PetscScalar** p))}|]
-- PETSC_EXTERN PetscErrorCode VecRestoreArray(Vec,PetscScalar**);
vecRestoreArrayPtr' :: Vec -> Ptr PetscScalar_ -> IO CInt
vecRestoreArrayPtr' v c = with c $ \pc -> vra v pc
where
vra w pc = [C.exp|int{VecRestoreArray($(Vec w), $(PetscScalar** pc))}|]
此外,IIUC 的代码制作了 2 个额外的向量副本,一份在冻结时,一份在解冻时。 ,但我怀疑它效率低下。有人可以提出改进或简化的建议吗?
【问题讨论】:
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Vec类型中的指针似乎已被vecRestoreArrayPtr更新。错误可能在此函数中,因此您也应该包含它。 -
谢谢 user2407038 ,已编辑
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另外,您可以通过将
thaw替换为unsafeThaw来删除副本,这不会生成副本。我认为这应该是安全的,因为无论如何你都会用计算结果覆盖你的Vec。但是,如果发生异常,您可能会处于不一致的状态 - 最好还是复制它。
标签: haskell vector ffi mutable numerical-computing