获取 Job id 并将它们放入 bash 命令答案

【问题标题】：Get Job id and put them into a bash command获取 Job id 并将它们放入 bash 命令
【发布时间】：2020-06-28 17:17:20
【问题描述】：

你好，对于一个项目，我只需要在之前的所有运行都完成后才执行一个 bash 文件，所以我使用：

sbatch -d afterok:$JobID1:$JobID2:$JobIDN final.sh

为了运行我所做的 JobIDN

for job in Job*.sh ; do sbatch $job; done

然后它打印所有jobIDs

我只是想知道是否有人有一个命令来获取这些 ID 并将它们直接放入命令中：

sbatch -d afterok:$JobID1:$JobID2:$JobIDN final.sh

例子

for job in Job*.sh ; do sbatch $job; done 
1
2
3


sbatch -d afterok:$1:$2:$3 final.sh

【问题讨论】：

【解决方案1】：

你可以这样做

for job in Job*.sh ; do sbatch --parsable $job; done | paste -s -d: | xargs -I{} sbatch --depedency afterok:{} final.sh

paste 命令将收集所有作业 IDS 并将它们写入一行，用冒号分隔，而xargs 将获取结果并将其插入到 {} 占位符处。有关作业 ID 的信息通过管道传递。

【讨论】：

【解决方案2】：

您可以将作业 ID 存储在一个变量中，并将其用于您的下一个命令。类似的东西

jobs=$(seq 1 10 | awk '{ printf ":%s", $1 }')
     # \------/
 # your jobID printing function here

然后

sbatch -d afterok"$jobs" final.sh

【讨论】：