使用 sed 或 awk 修改文件中的文本答案

【问题标题】：Modifying text within a file using sed or awk使用 sed 或 awk 修改文件中的文本
【发布时间】：2012-12-07 10:36:17
【问题描述】：

我正在尝试修改文件以打印第二列的一部分，并在其下一行显示相应的序列。我尝试了 awk、sed 和 grep，但我只得到了部分文本。

>hg19_ct_UserTrack_3545_(null) range=chr1:20802866-20802871 5'pad=0 3'pad=0 strand=+ repeatMasking=none
GATAAG
>hg19_ct_UserTrack_3545_(null) range=chr1:23866529-23866534 5'pad=0 3'pad=0 strand=+ repeatMasking=none
TTATCT
>hg19_ct_UserTrack_3545_(null) range=chr1:24345525-24345530 5'pad=0 3'pad=0 strand=+ repeatMasking=none
GATAAG

到

chr1 20802866 20802871  GATAAG
chr1 23866529 23866534  TTATCT
chr1 24345525 24345530  GATAAG

【问题讨论】：

标签： text sed awk editing

【解决方案1】：

awk -F'[=: -]' '/^>/{s=$3" "$4" "$5; next} {print s,$0}' file

【讨论】：

【解决方案2】：

$ sed 'N; s/.*range=\([[:alnum:]]*\):\([[:digit:]]*\)-\([[:digit:]]*\).*\n\([[:alpha:]]*\)/\1 \2 \3 \4/' test.fa
chr1 20802866 20802871 GATAAG
chr1 23866529 23866534 TTATCT
chr1 24345525 24345530 GATAAG

【讨论】：

@user1879573 No problem，顺便说一句，如果它解决了你的问题，你可以将答案标记为accepted。

【解决方案3】：

另一种解决方案：

awk -F "[=: -]" '{getline a; print $3,$4,$5,a}' file

【讨论】：

以上不是getline的安全或适当使用。在您阅读并完全理解 awk.info/?tip/getline 之前，请勿使用 getline。
@Ed Morton，你能解释一下为什么我的例子不正确吗？谢谢。
我写了那篇文章，这样我和其他人就不必一直解释它了。一旦你理解了那篇文章，你就不会再像这样使用 getline 了。 getline 是一个有用的工具，但 awks 的主要功能是读取文件中的每一行并对每一行应用条件/操作规则，因此使用 getline 来规避这种行为有点像骑自行车。
@Ed Morton，你是对的。我只会将 getline 用作最后的手段。
关键是在适当的时候使用它。那篇文章显示了一个非常完整的列表，说明了何时适合使用 getline，以及在这些情况下使用它时它是一个非常宝贵的工具。