Python单元测试和导入错误答案

【问题标题】：Python Unittest and import errorPython单元测试和导入错误
【发布时间】：2014-09-12 10:26:24
【问题描述】：

我发现了很多类似的帖子。但是，那些帖子并没有解决我的问题。所以我想问关于我的问题的问题。我的问题出在单元测试和导入模块中。我的项目具有以下层次结构。

app/
   __init__.py
   src/
       __init__.py
       person.py
   tests/
       __init__.py
       test_person.py

我使用 pytest 进行单元测试。内部测试/test_person.py

## tests/test_person.py
from ..src import person

在 src/person.py 中

## src/person.py
from Bio import PDB

我从 app/ 运行 py.test 并得到了错误。

from Bio import PDB
E   ImportError: No module named Bio

我在命令行中进一步测试，检查是否可以导入 from Bio import PDB。它可以毫无错误地导入。

Python 2.7.4 (default, May 14 2013, 09:41:12) 
[GCC 4.4.6 20120305 (Red Hat 4.4.6-4)] on linux2
Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
>>> from Bio import PDB
>>>

我不知道是什么错误。有人猜到了吗？

【问题讨论】：

标签： python import pytest unit-testing

【解决方案1】：

在运行 python 时，请确保您当前的工作目录是 app 目录，否则 from Bio import PDB 可能由于其他原因而工作。您可以使用os.chdir 移动到app 目录，然后尝试导入，看看是否仍然有效。还有 - Bio 在哪里？

编辑：根据您的评论，问题是由使用不同版本的 Python 引起的。
要了解您使用的版本，您可以简单地print sys.version。确保在失败的import 行之前执行此操作：

import sys
print sys.version
from Bio import PDB

不管怎样，更改使用的Python版本的问题，已经在这里回答了：Two versions of python on linux. how to make 2.7 the default。

【讨论】：

是什么导致Bio使用命令行导入成功？它不在您上面提到的文件夹列表中。
更新：在我的系统中，由于程序依赖性，我已经放入了 python 版本 - python 2.6 和 python 2.7。我在/usr/bin/ 中安装了python2.6，在/usr/local/bin 中安装了python2.7。现在，当我使用 python2.6 时，没有出现模块错误 - from Bio import PDB。由于 py.test 也安装在 /user/bin 中，所以默认使用 py.test 时，我认为它使用来自 /usr/bin 的 python 而不是我的默认路径 /usr/local/bin。你能告诉我我怎么知道py.test正在使用什么（哪个python）？如何在 py.test 中自定义库路径？

【解决方案2】：

我找到了答案。主要问题是 py.test 默认使用 python2.6 并且在执行“from Bio import PDB”时也会引发错误。但是 Python2.7 在执行相同的命令时不会引发任何错误。在选择不同版本的python时做出选择。使用命令创建独立的 pytest 脚本，然后运行

py.test --genscript=curpytest
python curpytest

解决了导入Bio的错误。

【讨论】：