R从data.frame中选择一定间隔的行答案

【问题标题】：R Select certain interval of rows from data.frameR从data.frame中选择一定间隔的行
【发布时间】：2013-01-01 20:02:22
【问题描述】：

我试图通过 google 找到解决方案，但 5 小时后我希望我能从社区中找到答案，所以已经谢谢你了。

我有一个 data.frame：

    > out.allpheno["MAP2K2"]
            MAP2K2
c1m2      5.55e-02
c1.loc42  4.32e-02
c1.loc52  6.04e-02
c1m10     3.19e-01
c1.loc103 6.12e-01
c1.loc107 8.65e-01
c1m12     1.03e+00
c1.loc113 1.04e+00
c1.loc117 1.07e+00
c1.loc128 7.91e-01
c1m14     4.92e-01
c1.loc134 5.65e-01
c1.loc135 6.10e-01
c1.loc157 3.63e-01
c1m16     1.81e-01
c1.loc177 5.61e-02
c1m18     9.03e-02
c1.loc182 1.08e-01
c1m19     2.38e-01
c1m22     9.20e-02
c1.loc219 1.03e-01
c1m24     1.62e-01
c1.loc236 3.83e-01
c1.loc240 7.45e-01
c1.loc262 2.00e+00
c1.loc267 2.41e+00
c1.loc268 2.48e+00
c1.loc269 2.53e+00
c1.loc270 2.56e+00
c1m28     2.57e+00
c1.loc272 2.52e+00
c1.loc273 2.46e+00
c1.loc274 2.37e+00
c1.loc276 2.12e+00
c1m30     9.63e-01
c1m31     1.89e+00
c2m1      5.85e-01
c2.loc11  5.27e-01
c2m5      5.51e-01
c2m6      5.15e-01
c2.loc52  6.56e-01
c2m7      1.05e+00
c2.loc59  1.07e+00
c2.loc62  1.05e+00
c2.loc72  4.90e-01
c2.loc91  3.63e-01
c2m11     3.63e-01
c2.loc103 3.08e-01
c2.loc114 8.62e-02
c2m14     2.99e-02
c2.loc129 3.15e-02
c2.loc151 2.95e-02
c2.loc167 2.21e-01
c2.loc199 1.49e+00
c2.loc200 1.53e+00
c2.loc201 1.56e+00
c2.loc203 1.61e+00
c2.loc204 1.63e+00
c2m21     1.63e+00
c2.loc214 1.32e+00
c2.loc218 1.16e+00
c2.loc229 3.23e-01
c2.loc237 7.70e-03
c2.loc241 2.57e-02
c2m25     3.81e-02
c3.loc1   8.17e-01
c3.loc4   6.51e-01
c3.loc32  2.95e-01
c3.loc35  3.14e-01
c3m6      8.02e-01
c3.loc54  9.58e-01
c3.loc71  1.48e+00
c3.loc73  1.47e+00
c3m9      1.00e+00
c3.loc89  2.55e-01
c3m10     1.47e-01
c3.loc94  2.84e-01
c3m14     2.37e-01
c3m15     9.24e-04
c3.loc152 2.47e-02
c3m16     4.88e-02
c3.loc175 3.69e-05
c3.loc180 6.16e-02
c3m20     4.87e-01
c3.loc199 4.08e-01
c3m25     8.00e-02
c3.loc248 1.60e-01
c3m26     2.66e-01
c3.loc268 1.53e+00
c3.loc271 1.85e+00
c3.loc273 1.95e+00
c3m28     1.97e+00
c3m29     1.01e+00
c4m4      8.34e-03
c4.loc39  3.94e-03
c4m5      2.81e-03
c4.loc48  1.92e-02
c4.loc57  2.08e-02
c4m7      8.11e-03
c4.loc67  5.92e-03
c4m9      6.74e-02
c4m10     5.28e-01
c4m12     8.52e-01
c4.loc121 2.97e-01
c4m17     5.38e-02
c4m20     1.88e-02
c4m22     3.58e-01
c4m24     1.66e-02
c4.loc236 1.68e-02
c4.loc288 1.62e-01
c4.loc295 1.72e-01
c4m31     1.72e-01
c4.loc313 4.18e-03

我想检索从 c1m2 到 c2m25 的行。是否有任何内置功能来实现这一点，或者我是否需要创建一个循环并检查每一行是否有我想要包含的元素？谢谢

【问题讨论】：

标签： r select row dataframe intervals

【解决方案1】：

有序因子允许您使用 >= 和 <= 与字符值进行比较，定义自定义顺序（即，不同于字母顺序）。

这是一个比您要求的更短的子集，但您可以使用任何值作为边界：

f <- factor(rownames(out.allpheno), levels=rownames(out.allpheno), ordered=TRUE)
out.allpheno[f >= 'c1m14' & f <= 'c1m16', ,drop=FALSE]

##           MAP2K2
## c1m14      0.492
## c1.loc134  0.565
## c1.loc135  0.610
## c1.loc157  0.363
## c1m16      0.181

【讨论】：

我会像 Arun 那样做，但这是一个非常巧妙的技巧！
这是一个很好的解决方案。非常感谢。

【解决方案2】：

如果您已经将它们全部整理好，那么假设您的 data.frame 是 df

idx1 <- which(row.names(df) == "c1m2")
idx2 <- which(row.names(df) == "c1m25")
df[idx1:idx2, ]

【讨论】：

【解决方案3】：

另一个潜在的解决方案，使用正则表达式：

my_regex <- "^c[12]"
matched_rownames <- grep( my_regex, rownames(df), value=TRUE )
df[ rownames(df) %in% matched_rownames, , drop=FALSE ]

如果您确定行名确实遵循常规结构但它们可能是无序的，并且您知道您只想获取以 c1 或 @987654323 开头的任何行，这将非常方便@。

【讨论】：