【问题标题】:What is the relationship between marks and covariates in point process点过程中标记和协变量之间的关系是什么
【发布时间】:2015-04-27 09:50:15
【问题描述】:

我对点过程中的标记和协变量感到困惑。我正在尝试通过使用 spatstat 在 R 中创建一个带有少量协变量的标记点模式模型,但我不确定标记和协变量之间的关系。谁能帮帮我?

谢谢。

----更新 我有一个关于给定位置的定居点人口的给定点模式,并且很少有诸如土壤肥力、年降雨量等协变量。我想描述一下定居点的分布。

【问题讨论】:

  • 你的问题有点含糊。标题表明它与协方差有关,而文本谈论协变量。你能更具体一点吗?你有哪种类型的标记?什么是协方差?到目前为止,您对这个主题有什么了解?
  • @EgeRubak 我更新了我的规范。现在清楚了吗?

标签: process statistics point spatstat


【解决方案1】:

对于点过程,标记和协变量之间的区别是:

  • 标记是附加到每个点(结算)的值,通常标记在其他位置没有意义。

  • 协变量在整个调查区域(观察窗口)中具有概念意义/可用。

标记值原则上可以是任何值,但在撰写本文时,spatstat 基本上只支持两种类型:1)具有数值的标记和 2)分类(因子值)标记。在 spatstat 中,非常强调后者,称为“多类型”模式。对于多类型模式,您可以使用 spatstat 函数 ppm 构建模型,但目前没有用于带有数字标记的模式的建模工具。

要使用 spatstat 分析您的数据,您可能必须丢弃人口规模信息或使用 cut.ppp 将定居点划分为“大”、“中”和“小”等组或您认为有意义的组。研究,然后继续分析这种多型模式。

基于 cmets 的更新: 假设我们有一个多类型点模式 Xppp 类)和两个协变量图像 im1im2im 类) .那么对于每个标记级别具有相同协变量效应的泊松模型是:

ppm(X ~ marks + im1 + im2)

允许“交互”的模型,即每个因子水平的协变量的不同影响是:

ppm(X ~ marks * im1 + marks * im2)

对于这两种模型,模型的解释取决于力度对比(默认情况下是处理对比)。这与使用lmglm 完全一样。

【讨论】:

  • 谢谢。此外,我想开发一个带有协变量的标记点模式模型(没有点之间的相互作用),目前协变量是像素。使用 ppm(ppp, ~marks+covariate1+covariate2, covariates=list(covariate1 = im1, covatiate2=im2)) 来实现可以吗?
  • 对于较新版本的spatstat,语法很简单:ppm(ppp ~ marks + im1 + im2),其中pppim1im2 是您全局环境中的对象(顺便说一句。我不建议使用@ 987654336@ 作为模式的名称,因为它是类的名称)。该模型假设每个标记值具有相同的协变量效应(线性回归术语中的相同斜率),可能合理也可能不合理。
  • 不客气。要为每种标记类型制作具有不同效果(“斜率”)的模型,请执行以下操作:ppm(ppp ~ marks*im1 + marks*im2)
  • 是 ppm(ppp ~ 标记im1 + 标记im2) 交互版本吗?那么,如果标记是分类的,是不是改为数值auto?
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