为 pyFFTW 安装链接 fftw 库时出错

Question

我尝试将 pyFFTW 0.9.2 安装到 OSX 小牛，但遇到以下错误：

/usr/bin/clang -bundle -undefined dynamic_lookup
-L//anaconda/lib -arch x86_64 -arch x86_64 
build/temp.macosx-10.5-x86_64-2.7/anaconda/lib/python2.7/site-packages/pyFFTW-master/pyfftw/pyfftw.o 
-L//anaconda/lib -lfftw3 -lfftw3f -lfftw3l -lfftw3_threads -lfftw3f_threads -lfftw3l_threads 
-o build/lib.macosx-10.5-x86_64-2.7/pyfftw/pyfftw.so

ld: library not found for -lfftw3

clang: error: linker command failed with exit code 1 (use -v to see invocation)

如pyFFTW installation -> cannot find -lfftw3_threads所说，我尝试编译安装fftw 3.3.4 3次。但这对我不起作用。

我的做法是：

./configure --enable-float --enable-share  => make => make install
./configure --enable-long-double --enable-share  => make => make install
./configure --enable-threads --enable-share  => make => make install

然后我在 pyFFTW 文件夹中运行 python (2.7) 安装文件，我得到了上面的错误。

感谢您的帮助。

Answer 1

我在 OSX 10.9.4 Maverick 上遇到了同样的问题。 试试这个： 下载 FFTW 3.3.4，然后打开终端窗口并进入解压的 FFTW 目录并运行以下命令：

$ ./configure --enable-long-double --enable-threads
$ make
$ sudo make install
$ ./configure --enable-float --enable-threads
$ make
$ sudo make install

比建议使用 pip 安装 pyFFTW：

$ sudo pip install pyfftw

Answer 2

我正在使用通过conda 安装的 MacOX 10.11.4 和 Python 3.5.1，上述答案对我不起作用。

我仍然会收到此错误：

ld: library not found for -lfftw3l
clang: error: linker command failed with exit code 1 (use -v to see invocation)
error: command 'gcc' failed with exit status 1

----------------------------------------
Failed building wheel for pyfftw

或：

ld: library not found for -lfftw3l_threads
clang: error: linker command failed with exit code 1 (use -v to see invocation)
error: command 'gcc' failed with exit status 1

----------------------------------------
Failed building wheel for pyfftw

对我有用的与我发现的 here 略有不同：

先安装long-double库

comp:fftw-3.3.4 user$ ./configure --enable-threads --enable-shared --disable-fortran --enable-long-double CFLAGS="-O3 -fno-common -fomit-frame-pointer -fstrict-aliasing"
comp:fftw-3.3.4 user$ make
comp:fftw-3.3.4 user$ sudo make install

然后安装float和double库

comp:fftw-3.3.4 user$ ./configure --enable-threads --enable-shared --disable-fortran --enable-sse2 --enable-float CFLAGS="-O3 -fno-common -fomit-frame-pointer -fstrict-aliasing"
comp:fftw-3.3.4 user$ make
comp:fftw-3.3.4 user$ sudo make install
comp:fftw-3.3.4 user$ ./configure --enable-threads --enable-shared --disable-fortran --enable-sse2 CFLAGS="-O3 -fno-common -fomit-frame-pointer -fstrict-aliasing"
comp:fftw-3.3.4 user$ make
comp:fftw-3.3.4 user$ sudo make install

然后安装pyfftw

comp:fftw-3.3.4 user$ sudo -H  pip install pyfftw

我不认为--disable-fortran 和--enable-sse2 标志是必需的，我不确定sudo 对于pip 是否必要，但这对我有用。

请注意，完成后，您的 /usr/local/lib 文件夹应包含以下文件：

libfftw3.3.dylib
libfftw3.a
libfftw3.dylib
libfftw3.la
libfftw3_threads.3.dylib
libfftw3_threads.a
libfftw3_threads.dylib
libfftw3_threads.la
libfftw3f.3.dylib
libfftw3f.a
libfftw3f.dylib
libfftw3f.la
libfftw3f_threads.3.dylib
libfftw3f_threads.a
libfftw3f_threads.dylib
libfftw3f_threads.la
libfftw3l.3.dylib
libfftw3l.a
libfftw3l.dylib
libfftw3l.la
libfftw3l_threads.3.dylib
libfftw3l_threads.a
libfftw3l_threads.dylib
libfftw3l_threads.la