如何强制 Altair 在特定轴上订购热图（矩形）？

Question

我正在尝试在 Altair 中创建集群热图。创建热图效果很好，但我无法根据另一列的值对行重新排序。

这是我使用 seaborn 创建热图的代码 sn-p：

import pandas as pd
import numpy as np
import seaborn as sns
import altair as alt
import random

iris = sns.load_dataset("iris")
species = iris.pop("species")

# Clustermap for rows only
g = sns.clustermap(iris, col_cluster=False, cmap="magma")

# Get the reodered indices
reordered_indices = g.dendrogram_row.reordered_ind

# Create a dictionary to add this information to the longform dataframe later
reordering_dict = pd.Series(reordered_indices, index=iris.index.values).to_dict()

# Converting iris to tidyform
iris.reset_index(level=0, inplace=True)
iris_tidy = pd.melt(iris, id_vars=["index"], var_name="Paramaeter", value_name="value")

# Adding the ordering information
iris_tidy['order'] = iris_tidy['index'].map(reordering_dict)

这将导致：

现在使用 Altair 进行同样的尝试：

# Plotting using Altair
alt.Chart(iris_tidy, width=500, height=500).mark_rect().encode(
    alt.X("Paramaeter:N", bin=False, sort=None),
    alt.Y("order:O", bin=False),
    alt.Color("value:Q", scale=alt.Scale(scheme="magma")),
    order=alt.Order("order:Q", sort="ascending"),
).configure_scale(bandPaddingInner=0).configure_view(strokeOpacity=0, stroke="transparent").configure_axisY(
    labels=False, ticks=False
).configure_axisX(
    labelAngle=0, ticks=False
)

给了我这个：

我认为我错误地使用了alt.order()。我假设这样做的一种方法是使用序数列 order 本身来定义 Y 轴 - 但我将放弃与 index 关联的标签。

Answer 1

如果要控制Y轴类别的排序顺序，可以使用y编码的sort属性。例如：

# Plotting using Altair
alt.Chart(iris_tidy, width=500, height=500).mark_rect().encode(
    alt.X("Paramaeter:N", bin=False, sort=None),
    alt.Y("index:O", sort=alt.EncodingSortField(field='order', order='ascending')),
    alt.Color("value:Q", scale=alt.Scale(scheme="magma")),
).configure_scale(bandPaddingInner=0).configure_view(strokeOpacity=0, stroke="transparent")

这与 seaborn 输出不匹配，但我认为这是因为计算出的 order 列没有反映 seaborn 图表中数据的顺序。