MATLAB图表 - 通过中心性平滑着色节点

Question

在 MATLAB 中，我有一个图表，我想绘制它的节点，根据它们的中心性度量对其进行着色。这是我目前绘制图表的方式：

sdc = centrality(G, 'degree');
V = plot(G);
for i=1:size(genes,1)
    highlight(V, [i], 'NodeColor', 'g');
end

当然，这只是将所有节点变为绿色。我要做的是根据sdc对应的值平滑地设置节点颜色，使值低的节点更蓝，值中等的节点绿黄色，值高的节点更红。有没有办法做到这一点？

Answer 1

首先，定义color map 或使用现有的。例如。名为turbo 的那个与所描述的非常相似。

在highlight 函数中，可以通过在'NodeColor' 参数后提供一个RGB 三元组来设置节点的颜色。例如，这会将节点设置为红色：

highlight(V, [i], 'NodeColor', [1 0 0]);

让我们将选择的颜色图存储在一个变量中，并使用一种智能的矩阵索引方式来创建一个N×3 大小的矩阵，其中包含sdc 向量中每个数据点所需的颜色。

cm = turbo;
sdc_colors = cm(round(normalize(sdc, 'range', [1, size(cm, 1)])), :);

第二行的解释如下：

1. 首先，size函数返回地图中的颜色数量
2. 创建从 1 到上述数字的范围（例如 [1,255]）
3. 输入数据经过标准化以涵盖此动态范围 (normalize)
4. 规范化的值被四舍五入为整数以成为有效的索引值
5. 颜色图 (cm) 使用此向量作为第一个索引，: 作为第二个参数进行索引，这会产生一个 N×3 矩阵，其中填充了每个数据点的适当颜色值。李>

创建所需颜色的矩阵后，可以在 for 循环中使用适当的索引调用它。所以完整的代码是：

cm = turbo;
sdc_colors = cm(round(normalize(sdc, 'range', [1, size(cm, 1)])), :);

for i=1:size(sdc,1)
    highlight(V, [i], 'NodeColor', sdc_colors(i, :));
end