【问题标题】:matplotlib shows different figure than saves from the show() windowmatplotlib 显示的图形与从 show() 窗口保存的图形不同
【发布时间】:2014-05-06 09:01:31
【问题描述】:

我使用 matplotlib 的 imshow() 绘制相当复杂的数据,所以我更喜欢在保存之前先目视检查它是否正常。所以我一般会调用pl​​t.show(),看看是否正常,然后在show()窗口中用GUI对话框手动保存。一切都很好,但最近我开始得到一个奇怪的东西。当我保存该图时,我得到了一张非常错误的图片,尽管它在 matplotlib 的交互式窗口中看起来非常好。 如果我缩放到特定位置然后保存我看到的内容,我会得到一个很好的数字。

所以,这是正确的(图片的一小部分,先缩放保存):

这个是放大图的大致相同区域,在我全部保存后:

由于某种原因,第二个中的像素要大得多!这对我来说很糟糕——正如你所看到的,它丢失了很多细节。

不幸的是,我的代码非常复杂,我无法使用一些随机生成的数据来重现它。在我开始分别绘制图片的两个三角形后出现了这个问题:我用np.loadtxt()读取了我的两个巨大的数据文件,得到np.triu(data1)np.tril(data2),掩码零,NAs,-inf和+inf然后绘制它们与plt.imshow(data, interpolation='none', origin='lower', extent=extent) 在同一轴上。我做了很多其他不同的事情来让它变得更好,但我想这并不重要,因为这一切都像以前的魅力一样起作用。

如果您需要了解我的代码中可能与此问题相关的任何其他具体内容,请告诉我。

【问题讨论】:

  • 在使用savefig 时是否设置了dpi?可能是默认值太低了。
  • 我不使用savefig,虽然我确实尝试过,但也很糟糕。我想我将dpi 设置为 300,但我不确定。

标签: python matplotlib


【解决方案1】:

当您以 png/jpg 格式保存图形时,您必须对其进行栅格化,将其转换为有限数量的像素。如果你想保持完整的分辨率,你有几个选择:

  • 使用非常高的dpi 参数,例如 900。保存绘图会很慢,而且许多图像查看器需要一些时间才能打开它,但信息就在那里,您可以随时对其进行裁剪。
  • 保存图像数据,即用于制作绘图的确切数字。每当您需要检查它时,以交互模式将其加载到 Matplotlib 中,导航到所需的角落并保存。
  • 使用 SVG:它是一种矢量图形格式,因此您不受像素的限制。

这里是如何使用 SVG:

import matplotlib
matplotlib.use('SVG')
import matplotlib.pyplot as plt

# Generate the image
plt.imshow(image, interpolation='none')
plt.savefig('output_image')

编辑:

要保存真正的 SVG,您需要从一开始就使用 SVG 后端,不幸的是,它与交互模式不兼容。一些后端,如 GTKCairo 似乎允许两者,但结果仍然是光栅化的,而不是真正的 SVG。

这可能是 matplotlib 中的一个错误,至少据我所知,它没有记录在案。

【讨论】:

  • 我总是使用 SVG。而且我认为这不是dpi相关的问题,因为像素很清晰,没有模糊或任何东西,它们只是更大,好像每个像素都由许多真实像素组成。
  • 你的图片有多大?我正在使用最大为 1e4 x 1e4 的矩阵进行测试,我看到了所有像素。
  • 你的 rc 文件有区别吗?交互模式不适用于 SVG 后端,因此它们可能使用不同的选项。
  • 1e4 差不多。我应该在我的 rc 文件中寻找什么?
  • 如果是某种插值,image.interpolate(或在 imshow 调用中设置interpolation='none')。注意none != None
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