ggnetwork数据导入格式答案

【问题标题】：ggnetwork data import formatggnetwork数据导入格式
【发布时间】：2018-01-24 13:20:33
【问题描述】：

我这辈子都不知道如何构造我的数据以供 ggnetwork 使用。

我有一个单独的程序，可以生成我选择的任何格式的结构化数据。鉴于 ggnetwork 数据可以是

推断一个节点与另一个节点之间的链接的数据（邻接样式）
将属性/值添加到边缘的数据
向节点添加属性/值的数据

如何导入这些？让我们一个一个来吧--

邻接数据

这部分我得到了——我只是通过代码创建一个矩阵

data <- matrix(c(1,0,3,0,5,6,1,2,3), nrow=3)
colnames(data)=rownames(data)=LETTERS[1:3]

net <- network(data, matrix.type="adjacency")

可行。直截了当。

节点属性

在the example here 我看到了这段代码：

n <- network(rgraph(10, tprob = 0.2), directed = FALSE)
n %v% "family" <- sample(letters[1:3], 10, replace = TRUE)
n %v% "importance" <- sample(1:3, 10, replace = TRUE)

我不知道n %v% 做了什么，但我希望能够转储node id, attribute val 并将其导入我的节点。

边缘值

再次，在我看到的示例中

e <- network.edgecount(n)
set.edge.attribute(n, "type", sample(letters[24:26], e, replace = TRUE))
set.edge.attribute(n, "day", sample(1:3, e, replace = TRUE))

但我不知道这意味着什么，也不知道如何通过将其附加到我的邻接列表来添加这些数据，因为这已经是 1-1 数据映射到边缘。

如何使用它们的 val 为我的边导入，并为我的节点 val 导入？

【问题讨论】：

根据网络包文档，%n% 和 %v% 运算符分别用作网络和顶点提取/分配功能的前端。跨度>
您能解释一下您的邻接矩阵吗（因为有些项不是 0 或 1）？你能添加一些数据样本吗？
@MrSmithGoesToWashington 我假设这是边缘值

标签： r ggnetwork

【解决方案1】：

假设

(1,0,3,0,5,6,1,2,3)

是你的价值，你可以试试这个：

imported_values <-  c(1,0,3,0,5,6,1,2,3)
data <- matrix(imported_values, nrow=3)
colnames(data)=rownames(data)=LETTERS[1:3]
net <- network(data, matrix.type="adjacency")
net %v% "importance" <- imported_values
ggplot(net, aes(x = x, y = y, xend = xend, yend = yend)) +
  geom_edges() +
  geom_nodes(aes(size = importance)) +
  theme_blank()

【讨论】：