从 Linux 在 R 3.6.0 中安装“udunits2”时如何解决“错误：找不到 libudunits2.a”？答案

【问题标题】：How to solve "Error: libudunits2.a not found" when installing "udunits2" in R 3.6.0 from Linux?从 Linux 在 R 3.6.0 中安装“udunits2”时如何解决“错误：找不到 libudunits2.a”？
【发布时间】：2020-04-15 16:48:06
【问题描述】：

我尝试使用以下方法在 Linux 中安装 udunits2（因为我需要 sf 包）：

install.packages("/panfs/roc/groups/5/.../udunits2_0.13.tar.gz", repos=NULL, type ="source")

但我收到此错误消息：

(as ‘lib’ is unspecified)
* installing *source* package ‘udunits2’ ...
** package ‘udunits2’ successfully unpacked and MD5 sums checked
** using staged installation
checking for gcc... /panfs/roc/msisoft/gcc/8.1.0/bin/gcc
checking whether the C compiler works... yes
checking for C compiler default output file name... a.out
checking for suffix of executables...
checking whether we are cross compiling... no
checking for suffix of object files... o
checking whether we are using the GNU C compiler... yes
checking whether /panfs/roc/msisoft/gcc/8.1.0/bin/gcc accepts -g... yes
checking for /panfs/roc/msisoft/gcc/8.1.0/bin/gcc option to accept ISO C89... none needed
checking for XML_ParserCreate in -lexpat... yes
...
checking for stdint.h... yes
checking for unistd.h... yes
checking udunits2.h usability... no
checking udunits2.h presence... no
checking for udunits2.h... no
checking for ut_read_xml in -ludunits2... no
-----Error: libudunits2.a not found-----
     If the udunits2 library is installed in a non-standard location,
     use --configure-args='--with-udunits2-lib=/usr/local/lib' for example,
     or --configure-args='--with-udunits2-include=/usr/include/udunits2'
     replacing paths with appropriate values for your installation.
     You can alternatively use the UDUNITS2_INCLUDE and UDUNITS2_LIB
     environment variables.
     If udunits2 is not installed, please install it.
     It is required for this package.
ERROR: configuration failed for package ‘udunits2’
* removing ‘/panfs/roc/groups/5/.../R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/udunits2’
Warning message:
In install.packages("/panfs/roc/groups/5/.../udunits2_0.13.tar.gz",  :
  installation of package ‘/panfs/roc/groups/5/.../udunits2_0.13.tar.gz’ had non-zero exit status
>

然后我尝试安装：libudunits2-dev、libgdal-dev、libgeos-dev 和 libproj-dev。但其中任何一个都可用于 R 版本 3.6.0。

有人有建议吗？我尝试了很多事情都没有成功。非常感谢！

【问题讨论】：

嗨。您是否已经尝试按照此处提供的安装所需库的说明：github.com/r-spatial/sf#linux ？
非常感谢伊布塞特。这个链接很有帮助！

标签： linux sf

【解决方案1】：

你误解了 sf 的依赖。 SF 需要 GDAL 才能执行。在 Linux，特别是 Ubuntu 中，这需要安装 Ubuntu 软件包：libudunits2-dev、libgdal-dev、libgeos-dev 和 libproj-dev。

而 udunits2 是一个 R 包，它也依赖于 Ubuntu 的 libudunits2。 SF的安装不需要安装udunits2。

正如 ibusett 的评论链接中所述，您可以执行以下操作：

apt-get -y update && apt-get install -y  libudunits2-dev libgdal-dev libgeos-dev libproj-dev

或者：

sudo add-apt-repository ppa:ubuntugis/ubuntugis-unstable
sudo apt-get update
sudo apt-get install libudunits2-dev libgdal-dev libgeos-dev libproj-dev

在 Ubuntu 的终端上，而不是在 R 的控制台上。

【讨论】：

【解决方案2】：

为了记录，如果您使用的是 conda，那就是问题所在。使用conda deactivate然后尝试安装包，对我来说解决它（当然我已经安装了artidata提到的包）

【讨论】：

@AdrianaCastilloCastillo 如果解决了它，你能把它作为正确的答案吗？谢谢你！