大型数据集的 Python 交互式绘图

Question

假设我有一个包含 100k 行的数据集（1000 个不同的时间、100 个不同的系列、每个的观察结果以及辅助信息）。我想创建如下内容： (1) 第一张图在 x 轴上有时间，在 y 轴上有不同系列（和标准误差）的平均值。 (2) 根据我们在面板 1 中悬停的时间片（垂直线），显示辅助信息与该时间片的序列值的（可能是向下采样的）散点图。

我为此研究了几个选项：(1) matplotlib + ipywidgets 似乎无法处理它，除非您通过滑块明确选择点。这也不能很好地转化为 html 导出。这并不理想，但可能是可行的。 (2) altair - 这个库非常漂亮，但据我了解，我需要给它整个数据集来处理交互，但它也不能处理超过 5kish 的数据点。这会排除我的用例，对吗？

关于如何进行的任何建议？在目前的情况下，我的要求是不可能的吗？

Answer 1

您可以在 Altair 中处理大于 5k 行的数据集，as specified in this section of the docs。

我认为最方便的解决方案之一是安装altair_data_server，然后在笔记本和脚本顶部添加alt.data_transformers.enable('data_server')。只要您的 Python 进程正在运行，此服务器就会向 Altair 提供数据，因此无需将所有数据包含在创建的图表规范中，这意味着将避免 5k 错误。主要缺点是，如果您导出为独立的 HTML，它将无法工作，因为您依赖于运行服务器 Python 进程的环境。