qsub：使用 -t 选项指定非连续数据集答案

【问题标题】：qsub: Specifying non-consecutive datasets with the -t optionqsub：使用 -t 选项指定非连续数据集
【发布时间】：2015-04-28 02:37:25
【问题描述】：

我正在使用qsub 命令向Sun Grid Engine 提交作业。 qsub 的 -t 选项使我能够指定要在其上调用脚本的数据集——例如，

$ qsub . . . -t 101-103 my_script.sh

我的问题是，是否可以使用 -t 选项指定非连续数据集？例如，假设我想在101 和103 上运行脚本，而不是102。我将如何做到这一点？

而且，更一般地说，我将如何选择任意编号的数据集？

我想要一个在实践中适用于大量数据集的答案——远远超出这个玩具示例中使用的两个。

【问题讨论】：

您是否尝试了多个-t 选择？即-t 101 -t 103? （不是 qsub 用户，只是应用了一个 quasi-std 命令行处理技巧；-)）祝你好运。
@shellter 啊，这对于我发布的玩具示例来说是个好主意，但实际上我必须指定 50 个数据集，其中没有一个是连续的，所以每个 -t 需要很多打字。
类似qsub $( for i in 100 103 ; do printf -- "-t %s " $i ; done) --other_qsub_opts ....，当然你可以用$(< jobList.txt)替换100 103。只是猜测 ;-) 祝你好运！

【解决方案1】：

对此不确定，但在解释-t 的段落中引用qsub's man page：

。 . .

option 参数中指定的任务 id 范围可以是单个数字，形式为 n-m 的简单范围或具有步长的范围。因此，由 2-10:2 指定的任务 ID 范围将导致任务 id 索引为 2、4、6、8 和 10，总共 5 个相同的任务，

。 . .

所以，也许：

$ qsub . . . -t 101-103:2 my_script.sh

会的。

【讨论】：

【解决方案2】：

如果目标是运行规则间隔的数据集——例如，1, 3, 5, . . . 或 10, 15, 20, . . .——那么@chrk 的答案就是要使用的。

对于任意编号的数据集，无法使用-t。但是，可以使用submit 命令（带有-f 选项）而不是qsub 来获得相同的功能。

$ submit . . . -s my_script.sh -f my_datasets.txt

文件my_datasets.txt 每行包含一个数据集，如

101
103

我不确定这个解决方案对于我的计算环境的特定配置有多具体。

【讨论】：