MySQL，RDS，锁定超时答案

【问题标题】：MySQL, RDS, Lock timeoutMySQL，RDS，锁定超时
【发布时间】：2015-03-19 22:48:21
【问题描述】：

我正在创建一个使用 RDS 的 MySQL 实例的应用程序，由节点和 python 程序访问。节点端很好，直到几天前，python 端也很好。现在 python 程序在简单查询上失败了：

我正在通过上下文管理器运行查询，如下所示：

with safeExecute(dbConnection.cursor()) as cursor:
    log('about to run SQL')
    sql = """UPDATE ts
             SET ts.fails = ts.fails + 1,
                ts.attempts = ts.attempts + 1
             WHERE ts.id = 206 """
    cursor.execute(sql)
    log('sql executed')

@contextmanager
def safeExecute(cursor):
    try:
        yield cursor
        log('attempting to commit')
        dbConnection.commit()
        log('committed')
    except MySQLdb.OperationalError as e:
            dbConnection.rollback()
        log("--CRITICAL--")    
        traceback.print_exc()
        sys.exit(1)
    except Exception as e:
        dbConnection.rollback()
        log("Caught DB exception: ")
        traceback.print_exc()
        sys.stdout.flush()
    finally:
        cursor.close()

控制台日志如下所示：

about to run sql
sql executed 
attempting to commit
ERROR 1205 (HY000): Lock wait timeout exceeded; try restarting transaction
      OR
OperationalError: (2006, 'MySQL server has gone away')

奇怪的是，这个错误是相当间歇的，并且不会总是到达同一点。有时会出现attempting to commit，而有时它永远不会超过cursor.execute()。

我还有两个类似的查询，只是更新了各种计数器。它有时会毫无问题地执行所有三个，有时会卡在其中一个上。这个应用程序不应该有任何并发问题，它会花费大约 30 秒的时间处理，然后按顺序运行上面的这些查询（因此不应该有任何竞争条件）。

但是，查看打开的表，它似乎没有被锁定（当我执行以下操作时查询正在运行）

mysql> show open tables where in_use>0;
+------------+------------+--------+-------------+
| Database   | Table      | In_use | Name_locked |
+------------+------------+--------+-------------+
| tearsheets | tearsheets |      1 |           0 |
+------------+------------+--------+-------------+

Show processlist 也没有透露任何信息。实际上它表明连接正在休眠：

 ID      | USER       | HOST            | DB         | COMMAND | TIME | STATE     | INFO                                                              |
 1230255 | <username>   | <ip-address> | <ts table> | Sleep   |   42 |           | NULL

state 是空白的，那里没有文字...

我该如何进一步调试呢？我不知道还能看什么。

【问题讨论】：

附带说明，如果您使用的是 innodb，那么我强烈建议您使用 innotop 查看锁定信息。当锁被其他事务阻止时，它将显示涉及哪些事务。

标签： python mysql amazon-rds

【解决方案1】：

我通过在每个事务后简单地关闭连接，然后为下一次数据库交互重新打开一个新事务来解决这个问题。不确定我的问题的最初原因是什么，但这似乎现在有效。

【讨论】：