randomForest::combine() 和列表中的对象

Question

为了在非常大的数据集上运行随机森林模型，我将数据分成多个块，并在每个块上运行 randomForest::randomForest()。生成的 randomForest 对象包含在列表中。我现在需要使用 randomForest::combine() 来组合来自每个数据块的树。

我的问题是，如何对列表中的所有对象使用诸如 combine() 之类的函数？据我了解，sapply() 等将一个函数应用于列表中的每个对象——这不是我想要做的。我需要对列表中的所有 randomForest 对象使用 combine() ；或者如果这不是直接可能的，我需要单独拉出每个对象并将其发送到 combine()。另一个问题是我有不同数量的数据块的不同数据集；我希望代码在块数方面具有灵活性。

我的列表 (rf.final) 包含对象“1”到“5”，每个对象都是 randomForest 对象：

> class(rf.final)
[1] "list"
> names(rf.final)
[1] "1" "2" "3" "4" "5"
> class(rf.final[[1]])
[1] "randomForest.formula" "randomForest"  

有 5 个对象只是因为我有 5 块数据用于这个特定的数据集。

我没有包含 str(rf.final)，因为输出很大 [即使只是 str(rf.final[[1]])] 但如果需要我可以。

Answer 1

我终于找到了解决办法！使用基础包中的 do.call() 函数。

即

rf.final2 <- do.call("combine", rf.final)