将基于指针的结构传递给 cuda答案

【问题标题】：Passing a pointer based struct to cuda将基于指针的结构传递给 cuda
【发布时间】：2011-11-06 17:04:25
【问题描述】：

我有一个使用指向struct 的指针的C 代码。我正在尝试弄清楚如何将其传递给 cuda，但运气不佳。

我有

typedef struct node {        /* describes a tip species or an ancestor */
  struct node *next, *back;  /* pointers to nodes                      */
 etc...
} node;

然后

typedef node **pointptr;
static pointptr treenode;

在我的代码中，我遍历了所有这些，并试图弄清楚如何将它们传递给内核，以便我可以执行以下操作：

for (i = 1; i <= nonodes; i++) {
    treenode[i - 1]->back = NULL;
    etc....
}

但我不知道如何通过它。有什么想法吗？

【问题讨论】：

标签： pointers struct cuda

【解决方案1】：

问题在于，为了在内核中使用您的树，您的 next 和 back 可能应该指向设备内存中的某个位置。假设您在主机上构建树然后传递它，您可以执行以下操作：

node* traverse(node*n){
    if (n==NULL)
        return NULL;

    node x, *d;
    x.back = traverse(n->back);
    x.next = traverse(n->next);
    cudaMalloc(&d, sizeof(node));
    cudaMemcpy(d, &x, sizeof(node), cudaMemcpyHostToDevice);
    return d;
}

通过在根目录上调用它，你最终会得到一个指向设备内存中树根的指针，你可以直接将它传递给你的内核。我没有测试过这段代码，你必须写一些类似的东西才能删除树。

或者，您可以将树节点连续存储在一个数组中，并在 back 和 next 中使用索引而不是指针（如有必要，可以将它们改回设备代码中的指针）。

【讨论】：

【解决方案2】：

检查这个问题：

Copying a multi-branch tree to GPU memory

虽然它没有准确地回答您的问题，但我认为它可能会解决一些问题并最终帮助您解决问题。

【讨论】：