【发布时间】:2021-12-28 18:23:26
【问题描述】:
为了测试一些功能,我想从一个字符串创建一个DataFrame。假设我的测试数据如下所示:
TESTDATA="""col1;col2;col3
1;4.4;99
2;4.5;200
3;4.7;65
4;3.2;140
"""
将这些数据读入 Pandas DataFrame 的最简单方法是什么?
【问题讨论】:
标签: python string pandas csv csv-import
为了测试一些功能,我想从一个字符串创建一个DataFrame。假设我的测试数据如下所示:
TESTDATA="""col1;col2;col3
1;4.4;99
2;4.5;200
3;4.7;65
4;3.2;140
"""
将这些数据读入 Pandas DataFrame 的最简单方法是什么?
【问题讨论】:
标签: python string pandas csv csv-import
一个简单的方法是使用StringIO.StringIO (python2) 或io.StringIO (python3) 并将其传递给pandas.read_csv 函数。例如:
import sys
if sys.version_info[0] < 3:
from StringIO import StringIO
else:
from io import StringIO
import pandas as pd
TESTDATA = StringIO("""col1;col2;col3
1;4.4;99
2;4.5;200
3;4.7;65
4;3.2;140
""")
df = pd.read_csv(TESTDATA, sep=";")
【讨论】:
pd.read_table() 是一个等效函数,只是命名法稍微好一点:df = pd.read_table(TESTDATA, sep=";")。
pandas.compat.StringIO。这样我们就不必单独导入StringIO。但是,根据pandas.pydata.org/pandas-docs/stable/api.html?highlight=compat,pandas.compat 包被认为是私有的,所以现在保留答案。
df.to_csv(TESTDATA) 创建TESTDATA,请使用TESTDATA.seek(0)
此答案适用于手动输入字符串时,而不是从某处读取时。
传统的可变宽度 CSV 无法将数据存储为字符串变量。特别是在 .py 文件中使用时,请考虑使用固定宽度的管道分隔数据。各种 IDE 和编辑器可能有一个插件来将管道分隔的文本格式化成一个整洁的表格。
read_csv
将以下内容存储在实用程序模块中,例如util/pandas.py。函数的文档字符串中包含一个示例。
import io
import re
import pandas as pd
def read_psv(str_input: str, **kwargs) -> pd.DataFrame:
"""Read a Pandas object from a pipe-separated table contained within a string.
Input example:
| int_score | ext_score | eligible |
| | 701 | True |
| 221.3 | 0 | False |
| | 576 | True |
| 300 | 600 | True |
The leading and trailing pipes are optional, but if one is present,
so must be the other.
`kwargs` are passed to `read_csv`. They must not include `sep`.
In PyCharm, the "Pipe Table Formatter" plugin has a "Format" feature that can
be used to neatly format a table.
Ref: https://stackoverflow.com/a/46471952/
"""
substitutions = [
('^ *', ''), # Remove leading spaces
(' *$', ''), # Remove trailing spaces
(r' *\| *', '|'), # Remove spaces between columns
]
if all(line.lstrip().startswith('|') and line.rstrip().endswith('|') for line in str_input.strip().split('\n')):
substitutions.extend([
(r'^\|', ''), # Remove redundant leading delimiter
(r'\|$', ''), # Remove redundant trailing delimiter
])
for pattern, replacement in substitutions:
str_input = re.sub(pattern, replacement, str_input, flags=re.MULTILINE)
return pd.read_csv(io.StringIO(str_input), sep='|', **kwargs)
下面的代码不能正常工作,因为它在左右两边都添加了一个空列。
df = pd.read_csv(io.StringIO(df_str), sep=r'\s*\|\s*', engine='python')
至于read_fwf,它doesn't actually use 有很多read_csv 接受和使用的可选kwargs。因此,它根本不应该用于管道分隔的数据。
【讨论】:
read_fwf 接受的read_csvs 参数比记录的要多,但some have no effect 确实如此。
一种快速简便的交互式工作解决方案是通过从剪贴板加载数据来复制和粘贴文本。
用鼠标选择字符串的内容:
在 Python shell 中使用read_clipboard()
>>> pd.read_clipboard()
col1;col2;col3
0 1;4.4;99
1 2;4.5;200
2 3;4.7;65
3 4;3.2;140
使用适当的分隔符:
>>> pd.read_clipboard(sep=';')
col1 col2 col3
0 1 4.4 99
1 2 4.5 200
2 3 4.7 65
3 4 3.2 140
>>> df = pd.read_clipboard(sep=';') # save to dataframe
【讨论】:
拆分方法
data = input_string
df = pd.DataFrame([x.split(';') for x in data.split('\n')])
print(df)
【讨论】:
df = pd.DataFrame([x.split(';') for x in data.split('\n')[1:]], columns=[x for x in data.split('\n')[0].split(';')])
最简单的方法是将其保存到临时文件然后读取:
import pandas as pd
CSV_FILE_NAME = 'temp_file.csv' # Consider creating temp file, look URL below
with open(CSV_FILE_NAME, 'w') as outfile:
outfile.write(TESTDATA)
df = pd.read_csv(CSV_FILE_NAME, sep=';')
创建临时文件的正确方法:How can I create a tmp file in Python?
【讨论】:
一行,但先导入IO
import pandas as pd
import io
TESTDATA="""col1;col2;col3
1;4.4;99
2;4.5;200
3;4.7;65
4;3.2;140
"""
df = pd.read_csv(io.StringIO(TESTDATA), sep=";")
print(df)
【讨论】:
对象:取字符串制作数据框。
def str2frame(estr, sep = ',', lineterm = '\n', set_header = True):
dat = [x.split(sep) for x in estr.split(lineterm)][1:-1]
cdf = pd.DataFrame(dat)
if set_header:
cdf = cdf.T.set_index(0, drop = True).T # flip, set ix, flip back
return cdf
estr = """
sym,date,strike,type
APPLE,20MAY20,50.0,Malus
ORANGE,22JUL20,50.0,Rutaceae
"""
cdf = str2frame(estr)
print(cdf)
0 sym date strike type
1 APPLE 20MAY20 50.0 Malus
2 ORANGE 22JUL20 50.0 Rutaceae
【讨论】: