使用 Sun Grid Engine 提交作业

Question

我第一次尝试使用 Sun Grid Engine 将作业提交到集群（运行 CentOS 6.3）。我有一个简单的程序，我想在集群上的 12 个内核上运行。我写了以下 .job 文件

#!/bin/sh
#$ -cwd
#$ -pe smp 12
#$ -q SB
#$ -j y
#$ -o out

module load intel/13.1.0
ifort -openmp omp_hello.f -o hello
hello

我使用 -pe smp 12 指定了并行环境。似乎 fortran 代码编译正常，因为我可以在作业运行后看到可执行文件，但是代码没有执行并且输出/错误文件来自工作给了我以下信息：

/opt/gridengine/default/spool/neon-compute-3-13/job_scripts/2569924: line 10: hello: command not found

是不是我做错了什么？任何的意见都将会有帮助。谢谢！

Answer 1

我需要使用 ./hello 来执行文件。修改后的 .job 文件看起来像

#!/bin/sh
#$ -cwd
#$ -pe smp 12
#$ -q SB
#$ -j y
#$ -o out

module load intel/13.1.0
ifort -openmp omp_hello.f -o hello
./hello