有没有办法从头开始在 Biopython Phylotree 中构建树？

Question

我正在尝试使用 Biopython Phylo 构建二叉树，但我无法将新子节点添加到当前节点，并且我没有 XML 文件或任何类型的类似数据可供读取。我只想编写代码，以便它构建并绘制具有不同边缘大小的树。这是我的代码：

from Bio.Phylo.BaseTree import Tree, Clade
from Bio import Phylo

lengths = [10, 12, 32, 44]
tree = Tree(rooted='True')
s = Clade(branch_length=lengths[0], clades = [Clade(branch_length=lengths[1]), Clade(branch_length=lengths[2])])
Phylo.draw(s)

a binary tree

将任何新的进化枝添加到列表中只会添加与此相同代的新分支，但我想通过向两个现有分支添加更多子代来扩展树。 我将不胜感激！

Answer 1

我找到了！这是一个小例子：

t = Tree(rooted='True')
c = Clade(branch_length=10, clades=[Clade(12, clades=[Clade(10), Clade(5)]), Clade(14)])
Phylo.draw(c)

clades() 内应该有 Clade()。 可能没有简单的方法让它迭代。