【发布时间】:2014-05-01 14:06:00
【问题描述】:
我正在使用 python2.7,并编写了一些用于分析蛋白质结构文件的函数,我将其保存为 pdbtools.py 一个函数,例如,getprot(),它可以让我从数据库中提取蛋白质结构.
在我打开和编辑文件并从 python 中保存它之后,我可以使用所有的函数定义。但是,当我启动一个新的 python 会话时,它会忘记我编写的所有函数,所以我必须 %edit pdbtools.pdb,保存它,然后才能运行所有内容。
这里发生了什么?我写的函数如何使用?
【问题讨论】:
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从 pdbtools 导入 getprot
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您在使用某种 IDE 吗?我不确定您所说的“从 Python 中保存”是什么意思,而且我不认识
%edit语法。 -
@Kevin - 来自IPython
标签: python bioinformatics biopython protein-database