网络图未在 Python 中沿边缘显示箭头答案

【问题标题】：Network graph not showing arrows along edge in Python网络图未在 Python 中沿边缘显示箭头
【发布时间】：2017-09-11 07:10:37
【问题描述】：

我有一个adjacency matrix A 和一个定义每个节点坐标的数组：

import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
import networkx as nx
%matplotlib inline  

Import adjacency matrix A[i,j]
A = np.matrix([[0, 1, 1, 0, 0, 1, 0],
               [0, 0, 1, 1, 0, 0, 0],
               [0, 0, 0, 1, 1, 1, 0],
               [0, 0, 0, 0, 1, 1, 0],
               [0, 0, 0, 0, 0, 0, 1], 
               [0, 0, 0, 0, 0, 0, 1],
               [0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]])

## Import node coordinates
xy = np.array([[0, 0],
               [-20, 20],
               [17, 27], 
               [-6, 49], 
               [15, 65], 
               [-20, 76],
               [5,  100]])

我的目标是绘制图表，显示节点之间的连接方式。因此，每条边都应该有一个箭头或双向箭头，指示沿着它前进的方向。

即使我将参数指定为True，我也能够显示连接但没有箭头。

## Draw newtwork
G = nx.from_numpy_matrix(A, xy)
nx.draw_networkx(G, pos=xy, width=3, arrows=True)

您能否建议我一种在不修改输入数据（A 和 xy）的情况下实现目标的方法？

【问题讨论】：

标签： python graph networkx adjacency-matrix

【解决方案1】：

在某些时候，我对 networkx 绘图工具中缺乏适当的箭头支持感到非常恼火，并编写了自己的工具，同时保持 API 几乎相同。代码可以在here找到。

import numpy as np
import netgraph

A = np.matrix([[0, 1, 1, 0, 0, 1, 0],
              [0, 0, 1, 1, 0, 0, 0],
              [0, 0, 0, 1, 1, 1, 0],
              [0, 0, 0, 0, 1, 1, 0],
              [0, 0, 0, 0, 0, 0, 1],
              [0, 0, 0, 0, 0, 0, 1],
              [0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]])

xy = np.array([[0, 0],
               [-20, 20],
               [17, 27],
               [-6, 49],
               [15, 65],
               [-20, 76],
               [5,  100]])

N = len(A)
node_labels = dict(zip(range(N), range(N)))
netgraph.draw(np.array(A), xy / np.float(np.max(xy)), node_labels=node_labels)

【讨论】：

【解决方案2】：

我设法得到了“箭”。从挖掘其他堆栈溢出问题（here, 和here）看来，这是使用 matplotlib 获取箭头的最佳方法。

import numpy as np
import networkx as nx
import matplotlib.pyplot as plt


#Import adjacency matrix A[i,j]
A = np.matrix([[0, 1, 1, 0, 0, 1, 0],
               [0, 0, 1, 1, 0, 0, 0],
               [0, 0, 0, 1, 1, 1, 0],
               [0, 0, 0, 0, 1, 1, 0],
               [0, 0, 0, 0, 0, 0, 1], 
               [0, 0, 0, 0, 0, 0, 1],
               [0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]])

## Import node coordinates
xy = np.array([[0, 0],
               [-20, 20],
               [17, 27], 
               [-6, 49], 
               [15, 65], 
               [-20, 76],
               [5,  100]]) 

G = nx.from_numpy_matrix(np.array(A), create_using = nx.MultiDiGraph())
pos = xy
nx.draw(G,pos)
labels = {i: i + 1 for i in G.nodes()}
nx.draw_networkx_labels(G, pos, labels, font_size=15, arrows=True)
plt.show()

【讨论】：

如果你想要节点顶部的标签，你还需要将位置传递给nx.draw。