尽管没有返回错误，为什么我的 princomp 情节为空？

【问题标题】：Why is my princomp plot empty despite returning no errors?尽管没有返回错误，为什么我的 princomp 情节为空？
【发布时间】：2019-02-13 10:30:18
【问题描述】：

Princomp 已用于汇总大型数据集，汇总、screeplot 和加载都是功能性的，并且所有代码都是从早期的 pca 中重复的。绘图的代码也非常相似，运行时不会返回错误，但绘图完全是空的。

这最初是在原始代码中发生的，但问题似乎通过再次运行 princomp 和 summary 解决了，这次这个解决方案没有奏效。

Plot_chars.abio.pca <-princomp(Plot_chars_standardised[,4:12]) 
summary(Plot_chars.abio.pca)

Plot_chars.abio.pca$loadings

screeplot(Plot_chars.abio.pca, type="lines")


Plot_chars.abio.pca.var <- Plot_chars.all.pca$sdev^2
Plot_chars.abio.pca.var[1:5]

plot(Plot_chars.abio.pca$x[,1], Plot_chars.abio.pca$x[,2],
bty = "n",
pch = Plot_chars$DomSpec -20,
cex =0.5,
col= Plot_chars$DomSpec -10, 
xlim = c(-2,6),
ylim = c(-2,6),
xlab = "PCA1",
ylab = "PCA2")

我期待绘制 PC1 和 PC2 点，但没有出现

【问题讨论】：

标签： r plot pca

【解决方案1】：

princomp 的结果不包含名为 x 的列。对于分数图，PC1 使用Plot_chars.abio.pca$scores[, 1]，Plot_chars.abio.pca$scores[, 2]。对于载荷图，使用Plot_chars.abio.pca$loadings[, 1] 表示 PC1 中的载荷，使用Plot_chars.abio.pca$loadings[, 2] 表示 PC2 中的载荷。

你的例子：

plot(Plot_chars.abio.pca$scores[,1], Plot_chars.abio.pca$scores[,2],
bty = "n",
pch = Plot_chars$DomSpec -20,
cex =0.5,
col= Plot_chars$DomSpec -10, 
xlim = c(-2,6),
ylim = c(-2,6),
xlab = "PCA1",
ylab = "PCA2")

【讨论】：

非常感谢！我正在遵循一些课堂说明，这些说明告诉我要包括 x。效果很好。